Oncomine数据库：如何不做实验利用生物信息分析发表医学SCI论文-360期刊网

　　少做实验or不做实验，短时间内发高分paper，也只有生物信息分析能做到了。小编在此分享一个家族基因生信分析套路，让你在短时间内喜提8分+SCI!

家族基因生信分析

　　E2F转录因子(E2Fs)是一组编码转录因子家族的基因，参与多种肿瘤的发展。实验证据表明，E2Fs与乳腺癌的发生有关。然而，8种E2Fs的不同表达模式和预后价值尚未得到分析，因此作者将这8个基因于在线数据库进行进一步的分析验证。

　　1.在线分析网站

　　①Oncomine

　　https://www.oncomine.org/resource/login.html

　　②GEPIA

　　http://gepia.cancer-pku.cn/index.html

　　③Kaplan-Meier Plotter

　　http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background

　　④cBioPortal

　　https://www.cbioportal.org/

　　⑤DAVID

　　https://david.ncifcrf.gov/summary.jsp

　　2.分析步骤

　　首先作者比较了E2Fs在癌症中的转录水平。利用Oncomine数据库，搜索E2F家族8个基因在各种癌中的转录水平，进行整理，宏观的展现出E2F家族在乳腺癌中表达的高低水平。

Oncomine数据库

　　作者又在Oncomine 数据库中搜索并整理了不同类型乳腺癌与正常乳腺组织E2F转录水平的显着变化。

　　数据显示，乳腺癌组织中E2F1 mRNA表达水平显著升高。在Glück的数据集中，E2F1 在浸润性乳腺癌中高表达，与正常组织相比有2.545倍的改变。在癌症基因组图谱中，E2F1在浸润性中也过高表达。Glück等表明，浸润性乳腺癌中E2F2也较正常人增加(倍数变化=2.637)。

利用生物信息分析发表医学SCI论文

　　作者比较了正常组织和乳腺癌组织中E2F因子mRNA的表达。结果表明，E2F1、E2F2、E2F3、E2F5、E2F7和E2F8的表达水平不同。乳腺癌组织中E2F6的表达水平高于正常组织，而E2F6在乳腺癌组织中的表达水平低于正常组织。

利用生物信息分析发表医学SCI论文

　　作者还分析了E2Fs在肿瘤中的表达。乳腺癌的分期。E2F1和E2F3组差异显著，而E2F2、E2F4、E2F5、E2F6、E2F7和E2F8组差异不显著。

利用生物信息分析发表医学SCI论文

　　利用Kaplan-Meier Plotter在线网站分析E2Fs基因表达水平与乳腺癌患者生存率的关系。Kaplan-Meier曲线和log秩检验表明，E2f1-3、5、7和8的mRNA水平升高，而e2f4和6的mRNA水平显著降低。所有乳腺癌患者的总生存率(OS)、无进展生存(FP)和进展后生存(PPS)的ED(P<0.05)。乳腺癌患者e2f1-3、5、7和8的mRNA水平较高时，预测E2f4和6的mRNA水平较低，即OS、FP和PPS较高。

利用生物信息分析发表医学SCI论文