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SEMA6B 最后一个外显子的新生截断变异引起进行性肌阵挛性癫痫。

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Abstract:

: De novo 变异体 (DNVs) 引起许多遗传性疾病。在新一代测序分析中,当在基因的整个编码区检测 DNVs 时,致病性 DNVs 往往聚集在一个特定的区域。一个这样的区域是倒数第二个外显子的最后一个外显子和最后一个 50 bp,其中截断的 DNVs 引起无义介导的 mRNA 衰变的逃逸 [NMD (-) 区域]。这种变体可以具有显性负效应或功能增益效应。在这里,我们首先在 DNVs 的零模型下开发了 NMD (-) 区域中 DNVs 截断率的资源。利用这一资源,我们对 346 例发育性和癫痫性脑病 (DEE) 三个进行了 NMD (-) 区域截断 DNVs 的富集分析。我们在 semaphorin 6B (SEMA6B) 中观察到截断 DNVs 的统计学显著富集 (p值: 2.8 × 10-8; 外显子组宽阈值: 2.5 × 10-6)。对 346 个个体的初步分析和对 1,406 个和 4,293 个受 DEE 和发育障碍影响的独立个体的额外筛查共同确定了 SEMA6B NMD 中的四个截断 dnv (-) 5 例来自无血缘关系家系 (p值: 1.9 × 10-13) 且一致表现为进行性肌阵挛性癫痫的个体。从一个受影响的个体建立的淋巴母细胞样细胞的 RNA 分析显示,突变等位基因逃逸了 NMD,表明截短蛋白的稳定产生。重要的是,在一般人群中观察到 SEMA6B 的 NMD (+) 区域的杂合截断变异,SEMA6B 很可能是功能缺失耐受的。在 SEMA6B 直系同源物的 NMD (-) 区域表达截断变异体的斑马鱼表现出脑神经细胞发育缺陷,增强了戊四氮诱导的癫痫发作行为。总之,我们发现 SEMA6B 最后外显子截断 DNVs 会导致进行性肌阵挛性癫痫。

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AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS

AM J HUM GENET
最新影响因子:11.043 期刊ISSN:0002-9297 CiteScore:8.34
出版周期:Monthly 是否OA:YES 出版年份:1949

期刊官方网址:http://www.cell.com/AJHG/home

自引率:4.40% 研究方向:生物-遗传学
出版地区:UNITED STATES

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AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS 期刊简介

英文简介:

AJHG provides a record of research and review relating to heredity in humans and to the application of genetic principles in medicine and public policy, as well as in related areas of molecular and cell biology. Topics explored by AJHG include behavioral genetics, biochemical genetics, clinical genetics, cytogenetics, dysmorphology, gene therapy, genetic counseling, genetic epidemiology, genomics, immunogenetics, molecular genetics, neurogenetics, and population genetics. AJHG welcomes submissions of articles and reports on timely subjects concerning all aspects of human genetics, including studies of model organisms that are of direct relevance to human genetics. Manuscripts should be written in a manner accessible to investigators representing diverse backgrounds in human genetics. Descriptions of new statistical methods of general interest to the genetics community are welcome. New methods should be compared to existing methods with the use of real data and/or simulations with parameters (e.g., haplotype frequencies, effect sizes) that are based on a real data example (e.g., marker or haplotype data from the HapMap project). All novel computer programs must be made publicly available by the time that the manuscript is published, and a URL for the website must be included in the Web Resources section of the manuscript. Letters commenting on material previously published in AJHG are also welcome. AJHG does not publish reports of either single mutations or mutational surveys of previously identified loci unless they have unusual significance and substantial insight. Descriptions of new linkage assignments will be considered only if they are of special interest. Reports of negative data will not normally be considered.

中文简介:(来自Google、百度翻译)

AJHG提供了关于人类遗传、遗传原理在医学和公共政策中的应用以及分子和细胞生物学相关领域的研究和综述的记录。AJHG探索的主题包括行为遗传学、生物化学遗传学、临床遗传学、细胞遗传学、畸形学、基因治疗、遗传咨询、遗传流行病学、基因组学、免疫遗传学、分子遗传学、神经遗传学和群体遗传学。 AJHG欢迎提交关于人类遗传学各方面及时主题的文章和报告,包括与人类遗传学直接相关的模型生物体的研究。手稿应该以一种让代表人类遗传学不同背景的研究人员能够理解的方式来写。欢迎介绍遗传学界普遍感兴趣的新统计方法。新方法应该与现有方法进行比较,使用真实数据和/或基于真实数据示例的参数(例如,单倍型频率、效果大小)进行模拟(例如,来自HapMap项目的标记或单倍型数据)。所有小说的计算机程序必须在手稿出版前公开,并且手稿的Web资源部分必须包含网站的URL。也欢迎来信评论以前在AJHG上发表的材料。 AJHG不发表关于单个突变的报告,也不发表对先前确定基因座的突变调查报告,除非它们具有不寻常的意义和实质性的见解。只有在特别感兴趣的情况下,才会考虑对新链接分配的说明。负面数据的报告通常不予考虑。

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#274
Maydica 0.59 第12百分位
#275
International Journal Bioautomation 0.56 第11百分位
#276
Current Bioinformatics 0.55 第11百分位
#277
Balkan Journal of Medical Genetics 0.51 第10百分位
#278
Journal of Crop Improvement 0.51 第10百分位
#279
Molluscan Research 0.51 第10百分位
#280
Genomics Insights 0.50 第9百分位
#281
Genetika 0.49 第9百分位
#282
Iranian Journal of Biotechnology 0.49 第9百分位
#283
Russian Journal of Genetics 0.49 第9百分位
#284
Indian Journal of Genetics and Plant Breeding 0.45 第8百分位
#285
Cytologia 0.42 第8百分位
#286
Sabrao Journal of Breeding and Genetics 0.41 第7百分位
#287
Nucleus (India) 0.40 第7百分位
#288
Genome Integrity 0.38 第7百分位
#289
Gene Reports 0.37 第6百分位
#290
Revista Fitotecnia Mexicana 0.36 第6百分位
#291
Agri Gene 0.35 第6百分位
#292
Chinese Journal of Applied and Environmental Biology 0.35 第6百分位
#293
Ecological Genetics and Genomics 0.33 第5百分位
#294
Journal of Integrated OMICS 0.33 第5百分位
#295
Russian Journal of Genetics: Applied Research 0.32 第5百分位
#296
Mitochondrial DNA Part B: Resources 0.30 第4百分位
#297
Cytology and Genetics 0.28 第4百分位
#298
Mitochondrial DNA Part A: DNA Mapping, Sequencing, and Analysis 0.25 第3百分位
#299
Molecular Genetics, Microbiology and Virology 0.25 第3百分位
#300
Journal of Biotech Research 0.22 第3百分位
#301
In Silico Biology 0.20 第3百分位
#302
Forum on Immunopathological Diseases and Therapeutics 0.18 第2百分位
#303
Medizinische Genetik 0.17 第2百分位
#304
Analele Universitatii din Oradea, Fascicula Biologie 0.13 第1百分位
#305
Epigenetics and Human Health 0.13 第1百分位
#306
Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 0.11 第1百分位
#307
Genetics in the Third Millennium 0.09 第1百分位
#308
Iranian Journal of Plant Physiology 0.06 第0百分位
#309
Japanese Journal of Crop Science 0.06 第0百分位
#310
Cardiogenetics 0.00 第0百分位
aaa
#4 89
AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS 8.34 第96百分位
排名
来源出版物名称 CiteScore2017 百分位
#1
Nature Reviews Genetics 17.21 第99百分位
#2
Genome Research 11.65 第98百分位
#3
Annual Review of Genomics and Human Genetics 9.77 第97百分位
#4
American Journal of Human Genetics 8.34 第96百分位
#5
Genome Medicine 6.61 第94百分位
#6
Genetics in Medicine 6.36 第93百分位
#7
PLoS Genetics 5.57 第92百分位
#8
Journal of Medical Genetics 5.46 第91百分位
#9
Clinical Epigenetics 5.44 第90百分位
#10
Human Molecular Genetics 5.31 第89百分位
#11
Application of Clinical Genetics 5.15 第88百分位
#12
Genes and Diseases 4.74 第87百分位
#13
Journal of Molecular Medicine 4.54 第85百分位
#14
Human Mutation 4.52 第84百分位
#15
Human Genetics 4.37 第83百分位
#16
American Journal of Medical Genetics, Part C: Seminars in Medical Genetics 4.28 第82百分位
#17
Circulation: Cardiovascular Genetics 3.95 第81百分位
#18
Frontiers in Genetics 3.78 第80百分位
#19
Heredity 3.75 第79百分位
#20
Chromosoma 3.69 第78百分位
#21
Genes 3.55 第76百分位
#22
Autism Research 3.48 第75百分位
#23
BMC Medical Genomics 3.41 第74百分位
#24
npj Genomic Medicine 3.41 第74百分位
#25
Molecular Medicine 3.38 第72百分位
#26
Orphanet Journal of Rare Diseases 3.35 第71百分位
#27
Journal of Inherited Metabolic Disease 3.30 第70百分位
#28
Environmental and Molecular Mutagenesis 3.27 第69百分位
#29
Cytotherapy 3.26 第67百分位
#30
European Journal of Human Genetics 3.05 第66百分位
#31
American Journal of Medical Genetics, Part B: Neuropsychiatric Genetics 2.80 第65百分位
#32
Neurogenetics 2.74 第64百分位
#33
BMC Genetics 2.67 第63百分位
#34
G3: Genes, Genomes, Genetics 2.66 第62百分位
#35
Clinical Genetics 2.62 第61百分位
#36
Mutagenesis 2.61 第60百分位
#37
Genes and Immunity 2.53 第58百分位
#38
Pharmacogenetics and Genomics 2.50 第57百分位
#39
Journal of Assisted Reproduction and Genetics 2.49 第56百分位
#40
Journal of Human Genetics 2.47 第55百分位
#41
Neuromuscular Disorders 2.43 第54百分位
#42
Journal of Heredity 2.33 第53百分位
#43
BMC Medical Genetics 2.31 第52百分位
#44
Human gene therapy methods 2.30 第51百分位
#45
Genetics Research International 2.26 第50百分位
#46
Genetic Epidemiology 2.24 第48百分位
#47
Prenatal Diagnosis 2.24 第48百分位
#48
European Journal of Medical Genetics 2.21 第46百分位
#49
Hereditary Cancer in Clinical Practice 2.21 第46百分位
#50
Public Health Genomics 2.17 第44百分位
#51
Current Genomics 2.15 第42百分位
#52
Journal of Cardiovascular Translational Research 2.15 第42百分位
#53
Behavior Genetics 2.10 第41百分位
#54
Familial Cancer 2.03 第39百分位
#55
Current Gene Therapy 2.00 第38百分位
#56
American Journal of Medical Genetics, Part A 1.86 第37百分位
#57
Human gene therapy. Clinical development 1.86 第37百分位
#58
Current Protocols in Human Genetics 1.83 第35百分位
#59
Haemophilia 1.77 第34百分位
#60
Annals of Human Genetics 1.72 第33百分位
#61
Journal of Gene Medicine 1.69 第32百分位
#62
Journal of Genetic Counseling 1.66 第30百分位
#63
Molecular Syndromology 1.65 第29百分位
#64
Meta Gene 1.57 第28百分位
#65
Cytogenetic and Genome Research 1.51 第26百分位
#66
Psychiatric Genetics 1.51 第26百分位
#67
Clinical Respiratory Journal 1.48 第25百分位
#68
Twin Research and Human Genetics 1.39 第24百分位
#69
Journal of Community Genetics 1.35 第23百分位
#70
CONTINUUM Lifelong Learning in Neurology 1.31 第21百分位
#71
Molecular Cytogenetics 1.23 第20百分位
#72
Ophthalmic Genetics 1.20 第19百分位
#73
Genetic Testing and Molecular Biomarkers 1.18 第18百分位
#74
Human Heredity 1.14 第17百分位
#75
International Journal of Immunogenetics 0.95 第16百分位
#76
Hemoglobin 0.72 第15百分位
#77
Recent advances in DNA 0.69 第14百分位
#78
Human Biology 0.66 第12百分位
#79
Egyptian Journal of Medical Human Genetics 0.53 第11百分位
#80
Balkan Journal of Medical Genetics 0.51 第10百分位
#81
Clinical Dysmorphology 0.42 第9百分位
#82
New Bioethics 0.31 第8百分位
#83
Cytology and Genetics 0.28 第7百分位
#84
Chinese Journal of Medical Genetics 0.24 第6百分位
#85
Medizinische Genetik 0.17 第5百分位
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Genetic Counseling 0.14 第3百分位
#87
Current Pharmacogenomics and Personalized Medicine 0.11 第2百分位
#88
Cardiogenetics 0.00 第1百分位
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Monographs in human genetics 0.00 第1百分位

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