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Actinobacteria分离株的多相分类学研究
Actinobacteria class nov.一般包括具有超过50%G+C的DNA碱基组成的微生物,其中一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义.为了分离能够产生有用化合物的微生物菌种,我们将分离对象从已进行过深入研究的Streptomyces及其以外的放线菌扩大到所有的Actinobacteria,其中包括那些具有普通细菌形态的高G+C含量革兰阳性细菌.为了对Actinobacteria这一较新的研究领域有详细的了解,我们又对两株有弱生物活性的IMB02B-165和IMB02B-172进行了多相分类学研究.化学分类和系统分类的结果表明IMB02B-165、IMB02B-172菌株均属于Arthrobacter属中Arthrobacter globiformts/Arthrobacter citreus组.
关键词： Actinobacteria 化学分类 系统分类 多相分类 -
PCR快速鉴定actinobacteria三种模板制备方法的比较
目的本研究旨在建立准确、简便、快速的放线细菌鉴定技术,为普通和极端环境放线细菌资源的调查和开发利用创造条件.方法从放线细菌固体培养基上挑取少量菌体,用微波炉法快速制备基因组DNA作为PCR模板,与液体培养法得到的菌体以超声波法或冻融法制备的模板进行了PCR扩增效果的比较研究.结果PCR检测结果表明微波炉法制备的模板可进行有效的体外扩增,目的条带特异,而超声波法或冻融法并不对所有菌株有效,并有非特异扩增产物产生.结论组合微波炉法快速制备放线细菌基因组DNA技术和23S rRNA特异插入序列PCR扩增技术建立了准确、简便、快速的actinobacteria鉴别体系.
关键词： Actinobacteria 微波炉法 超声波法 冻融法 基因组DNA提取 -
两种Actinobacteria鉴定方法的比较
Actinobacteria classis nov.一般包括具有超过50% G+C的DNA碱基组成的微生物。其中的一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义。为了分离能产生有用物质的新型微生物，我们扩大了分离对象，从以前的Streptomyces和Streptomyces以外的放线菌扩大到所有的Actinobacteria。本论文实验中的Actinobacteria将特指那些具有普通细菌形态的高G+C含量革兰氏阳性细菌。为了能够将Actinobacteria和其它革兰氏阳性低G+C含量的细菌加以区分，我们建立了两种鉴定方法。一种是荧光原位杂交(FISH)方法，它具有准确和直观的优点。另外一种是PCR方法，因在Actinobacteria 23S rRNA基因的domain Ⅲ(螺旋区54a)有1个大约100个碱基的稳定插入片段，通过体外PCR扩增23S rDNA片段，并用琼脂糖电泳分析，可以简便地鉴定Actinobacteria。
关键词： Actinobacteria PCR 荧光原位杂交 插入片段 -
新型Actinobacteria荧光原位杂交(FISH)探针的设计和应用
Actinobacteria是形态上变化各异的,具有超过50%G+C的DNA碱基组成的,革兰氏染色呈阳性的微生物,放线菌是Actinobacteria的一个组成部分,它们可产生丰富的次级代谢产物.目前,临床上使用的抗生素中有三分之二来自于放线菌.具有普通细菌形态的Actinobacteria由于和放线菌具有相近的共同祖先,可能会具有一些其它的共性,是目前药物筛选中一个新的研究对象,但很难用形态观察的方法将之和其它细菌加以区分.本论文利用此类微生物16S rRNA基因同源性,设计了两个探针PA-1、PA-2并运用荧光原位杂交方法进行Actinobacteria的鉴定,G+C含量测定结果表明,这两个探针联合使用可直观、正确地鉴定Actinobacteria.
