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“定制”完美婴儿
事实上,“定制婴儿”并不是什么新名词.自从基因工程诞生尤其是试管婴儿出现以来,对“定制婴儿”的设想和隐忧就一直埋在科学家们心中.“定制婴儿”避免遗传疾病早在2004年,牛津词典就收录了这一词条,对其作出解释:“定制婴儿”是那些经由基因工程人工选择过基因组并结合体外受精技术培育的婴儿,以确保某种特殊的基因、特质的存在或缺失.那时候,对婴儿的定制主要有两个方向——避免遗传疾病和性别选择.
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干扰素诱导跨膜蛋白3 rs12252多态性与乙型流感病毒感染相关性研究
目的 了解干扰素诱导跨膜蛋白3(IFITM3) rs12252多态性与乙型流感感染之间的关联.方法 选择2014年1月-2015年4月北京地区流感样病例(ILI)监测乙型流感感染病例80例、严重急性呼吸道感染病例(SARI)监测乙型流感感染病例85例和健康对照人群65例.提取基因组DNA,使用高分辨率熔解曲线法和Sanger测序法检测IFITM3rs12252多态性..结果 ILI病例组IF-ITM3 rs12252基因型分布频率与对照组无显著性差异,但SARI病例组与对照组相比基因型分布频率具有显著差别.61.2%的SARI病例为IFITM3 rs12252 CC基因型,明显高于ILI病例和对照人群.隐性遗传模型显示CC基因型个体比TT基因型和CT基因型个体有更高的风险发展为乙型流感重症感染(OR =4.73,95%CI 2.42 ~9.22).结论 IFITM3 rs12252 CC基因型会导致较高的乙型流感重症感染风险.
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2017年安徽省宿州市人感染H7N9禽流感病毒基因组特征分析
目的 分析2017年安徽省宿州市人感染H7N9禽流感病毒的基因组分子进化特征.方法 收集宿州市4例H7N9病例的咽拭子样本,分离培养后进行扩增和测序,构建血凝素HA基因进化树并进行重要氨基酸位点的变异分析.结果 4株毒株的HA与A/He nan/15337/2017(H7N9)的相似度高(99%);神经氨酸酶NA与A/Changsha/44/2017(H7N9)的相似度高(99%~100%);其他内部基因与2013-2017年浙江省、湖南省、江西省和广东省等地区分离到的H9N2相似度较高(94%~100%).分子进化树显示均为长三角分支.HA蛋白受体结合位点未发生G186V、Q226L突变;NA蛋白上未发现耐神经氨酸酶的位点突变;PB2蛋白发生E627V突变;M1蛋白出现N30D、T215A突变;NS1蛋白出现P42S突变、盘状同源区域模块缺失;M2蛋白出现S31N突变.结论 4株人感染H7N9禽流感病毒均处于长三角分支,M2蛋白S31N突变提示对M2离子通道抑制剂出现耐药,应及时关注其遗传变异演变方向,为H7N9禽流感的有效防治提供科学依据.
关键词: 禽流感 基因组 序列同源性 人感染H7N9禽流感病毒 氨基酸位点 -
2017年珠海市暴发流行麻疹病毒遗传进化研究
目的 分析2017年广东省珠海市麻疹暴发流行期间麻疹病毒基因组序列和可能的传播来源. 方法 分段扩增2017年珠海市的第1株和后1株麻疹病毒毒株全基因组并测序,通过末端重叠序列拼接组成病毒全基因组序列并上传至GenBank.参考已公布的麻疹病毒全基因组序列,对病毒进行进化分析.结合流行病学调查,推测病毒的可能来源及传播途径.通过核苷酸序列推导病毒氨基酸序列,比对疫苗株Shanghai191,分析病毒氨基酸变异的意义. 结果 拼接后的麻疹病毒MVs/Zhuhai.CHN/10.17/2[H1](GenBank序列号:MG972194)基因组全长15894个核苷酸,编码6个结构蛋白和2个非结构蛋白.序列进化分析表明,病毒属麻疹病毒H1型.遗传距离上,与2007年分离自浙江的KJ755987.1的核苷酸同源性高,达99%(15783/15894).病毒N、P、V、C、M、F、H、L蛋白氨基酸序列与疫苗株Shanghai191的一致性分别为96.6%(507/525)、98.2%(498/507)、97.7%(292/299)、96.8%(180/186)、99.1%(332/335)、96.6%(534/553)、98.5%(08/617)和99.3%(2168/2183).结论 2017年珠海市麻疹病毒可能由浙江省的感染者传播并导致珠海本地暴发流行.病毒N、P、L和V蛋白的氨基酸变异可能使其在复制和转录功能、致病力、诱导宿主T细胞免疫功能及细胞体液免疫平衡方面与疫苗株Shanghai191出现差异.
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SARS冠状病毒基因组编码蛋白的研究进展
SARS冠状病毒是一种新的病毒,能够引起人体以急性肺损伤为主要表现的传染病,对这种病毒的研究引起全世界的高度关注.本文就SARS冠状病毒的基因组所编码的结构蛋白和酶的研究现状和预测加以综述,为SARS的诊断、治疗和研究提供理论依据.
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腺相关病毒载体研究进展
腺相关病毒作为基因治疗的载体,具有感染范围广,可长效稳定地表达外源基因,可定点整合至宿主基因组等诸多优点而备受青睐.近年来,有关腺相关病毒及重组腺相关病毒的生物学特点有不少研究进展,本文就此做一综述.
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腺病毒载体在皮肤科基因治疗中的应用
腺病毒载体是经去除腺病毒基因组的某些区而获得的,由于其诸多优点,正在成为皮肤科基因治疗中使用多的载体之一,本文就腺病毒载体的特点及其在皮肤科基因治疗中的应用进展,作一综述.
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N40:一种新近发现的由流感病毒PB1节段编码的蛋白
N40蛋白是一种新发现的甲型流感病毒表达产物,该蛋白由流感病毒基因组PBl节段编码,是流感病毒PBl蛋白的变体,同PB1蛋白相比在N末端有40个氨基酸残基的缺失.N40蛋白和PB1节段编码的另外两种产物(PB1蛋白、PB1-F2蛋白)在表达水平上相互关联.2009年甲型H1N1亚型流感病毒的基阗组中存在N40蛋白的开放阅读框.N40蛋白的生物学意义以及同流感病毒毒力的关系尚有待于深入研究.
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HSVI立即早期基因研究进展
相对于其它病毒而言,单纯疱疹病毒的基因组巨人,基因数日繁多,根据其基因转录的先后顺序,分为立即早期、早期利晚期基因二类.作为病毒首先表达的立即早期基因,它们的表达产物都为非结构蛋白,可对病毒的复制进行调控,决定了病毒进入细胞后的命运.因此对单纯疱疹病毒的立即早期基因的定位、命名、翻译后修饰以及对其产物功能的分析对该病毒的分子生物学的病理学研究具有重要的意义.
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柯萨奇B组病毒致病的分子生物学机制
本文对柯萨奇B组病毒(CVB)致病性与抗原性的近期研究内容进行了复习.CVB的每个血清型存在多种毒株,病毒基因组编码区与非编码区核苷酸决定CVB的致病力.心肌球蛋白的氨基酸序列与疾病的发生有关联.T细胞基因在CVB致病及CVB蛋白2PC在CVB性自身免疫反应中均有重要地位.
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HIV-1 LTR区转录功能研究进展
作为获得性免疫缺陷综合症(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)的病原体,HIV-1基因组结构复杂,编码大量调节蛋白与辅助蛋白.转录水平调节主要依赖细胞内前病毒长末端重复序列(1ong terminalrepeats,LTR)和病毒因子及大量细胞转录因子的相互作用实现.本文就HIV-1 LTR区的转录调节功能的研究进展作一综述.
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轮状病毒分类与命名
轮状病毒(rotavirus,RV)是不含囊膜、有三层壳体、基因组为11个片段的双链RNA病毒,是人类、哺乳类和鸟类急性胃肠炎的重要病原体.RV结构复杂,成员众多,建立一个能区分不同病毒株及其基因型(血清型)的分类与命名系统,对深入研究RV生物学、免疫学性质及其分子遗传进化和亲缘关系,促进国际学术交流和有效预防与控制RV感染,具有重要的意义.
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EBV立即早期基因-BRLF1和BZLF1的研究进展
BRLF1和BZLF1是EBV基因组中位置相邻的两个立即早期基因.它们的蛋白表达产物Rta和Zta作为反式激活因子,可以调节EBV早期/晚期基因的表达,还可能参与病毒基因组的复制.它们与EBV感染由潜伏周期向裂解周期的转换密切相关.不同的细胞环境可能对它们的转录产生影响.Rta和Zta都包含CTL识别的表位,可能在病毒裂解周期的早期成为免疫系统识别的位点.对它们的研究还为某些EBV相关肿瘤的筛查和治疗提供了线索.这两个基因对EBV再激活的作用倍受关注.本文主要对BRLF1和BZLF1的基因结构和功能做一综述.Epstein-Barr病毒(EBV)是疱疹病毒科γ亚科成员,世界人口的90%感染此病毒.EBV可引起传染性单核细胞增多症,与Burkitt's淋巴瘤、鼻咽癌的发生密切相关.EBV有潜伏周期和裂解周期两种状态.EBV进入细胞后,通常很快进入潜伏期,病毒基因组环化成游离体(episome)并以此形式持续存在于细胞内.但病毒在少数感染细胞中可以进入增殖期,并产生病毒颗粒.研究表明,BZLF1和BRLF1两个基因在病毒由潜伏周期向裂解周期转变的过程中起重要作用.
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病毒与人类肿瘤
人类肿瘤的病因和发病机理迄今尚不清楚.肿瘤病毒是一种生物性致癌因子,具有生物的基本特性,含有DNA或RNA,能进行复制和遗传,产生子代病毒.肿瘤病毒对人有感染性,有些病毒对某些细胞具有特异亲嗜作用,引发疾病,并诱发肿瘤.肿瘤病毒的核酸能够整合到宿主细胞DNA链上,使人体细胞发生转化.有些肿瘤病毒基因组中含有病毒癌基因(viral oncogene,v-onc),可编码转化蛋白-癌蛋白(oncoprotein),使细胞发生恶性变化.RNA肿瘤病毒的v-onc,实际上起源于细胞癌基因(cellular oncogene,c-onc),两者序列同源.c-onc存在于正常细胞中,而它的异常激活产生过量的编码蛋白,而又可诱发癌变.
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人类乳头瘤病毒及其相关疾病
乳头瘤是由HPV引起的全身皮肤粘膜增生性疾病,尖锐湿疣又是重要的性传播疾病.HPV的基因组为双链封闭的环状DNA,含有8kb.HPV引起的良性乳头瘤可向恶性转化,这种转化过程往往需要较长时日.
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SV40(Simain Virus 40)的分子生物学研究进展
SV40(Simain Virus 40)是猿猴的病毒,但与多种人类肿瘤关系密切,因此引起人们的重视.SV40基因组较小,广泛的用于载体构建和细胞转化的研究.对于SV40的分子生物学特性及其与人类肿瘤的关系还在进一步研究中,本文就此综述了国内外相关的研究进展.
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丙型肝炎病毒基因编码的蛋白及其功能
丙型肝炎病毒(HCV)基因组是一单股正链RNA,全长9 600个碱基对(bp),含有一个大的开放读码框架(ORF),编码约3 010个氨基酸的病毒前体蛋白,HCV基因组5'端(5'UTR)和3'端(3'UTR)为非翻译区,或称非编码区(UCR),前者位于ORF上游;后者位于下游,含有poly A或ply U尾巴.
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巨细胞病毒感染的信号转导
巨细胞病毒是基因组大的病毒之一,感染机制多样复杂.本文就其感染细胞的上、中、下游信号转导环节、机制作一简要综述.
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猪链球菌wzy基因与血清型别的相关性分析
目的 分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性.方法 建立了33个已知血清型(1 ~31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1 ~ 20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对.结果 767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21.94.13% (722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致.在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异.结论 基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法.
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鼠疫与假结核耶尔森菌基因组比较分析
为了在流行静息期间建立鼠疫监测,比较自网上下载的10株鼠疫菌及3株假结核菌的全基因组序列.发现依照鼠疫菌CO92株划分的68个“板块”,67个在假结核菌中完整或大部出现,确定了这些板块在假结核菌基因组中的连接顺序.确定了假结核菌具有与鼠疫菌同样的7拷贝rRNA基因簇,并由此引起初的基因组重排.假结核菌与鼠疫菌分野前已在16个位置插入了4种插入序列,这些插入序列在假结核菌中尚未引起重排.确定了20处鼠疫菌特有的“疫岛(PeI)”与39处假结核菌特有的“假岛(PsI)”序列,这些序列可在监测中遇到非典型菌株时,用于鉴别鼠疫菌与假结核菌.