欢迎来到360期刊网!
学术期刊
  • 学术期刊
  • 文献
  • 百科
电话
您当前的位置:

首页 > 文献资料

  • 深圳市肾综合征出血热患者汉坦病毒基因特征研究

    作者:阳帆;张仁利;黄达娜;吴春利;李玥;唐屹君

    目的 研究深圳市引起肾综合征出血热(HFRS)的汉坦病毒主要型别及分子特征,为该市汉坦病毒的防制提供依据.方法 收集各医院送检HFRS患者急性期血清标本,提取血清中病毒RNA作为模板,采用逆转录-套式PCR扩增汉坦病毒基因组M片段G2区基因并进行序列测定,对汉坦病毒进行基因分型和同源性分析.结果 深圳市HFRS病例男性多于女性,患者发病年龄主要集中在20-60岁,其中20-49岁病例数多,共发病242例,占发病总数的85.82%.从282例标本中用HTN型特异性引物扩增阳性4例,占1.42%;用SEO型特异性引物扩增阳性50例,占17.73%;总阳性率为19.15%.序列比较分析发现,深圳地区流行的SEO型汉坦病毒核苷酸序列的差异相对较小,其基因的离散度为0%-4.9%.从种系发生树看这些病毒分布在一个分支上,均为S2亚型.HTN型汉坦病毒的变异率较高,其基因的离散度为6.7%-21.0%,二例为H7亚型,二例为H9亚型,均为深圳市首次报道.结论 不同年份引起深圳地区HFRS的汉坦病毒仍以SEO型为主,且病毒变异较小,稳定性较高.首次发现HTN型病例存在.结合流行病学调查资料,证实HTN病例均为输入性病例.

  • 柯萨奇病毒A组天津分离株的分型鉴定及分子特征分析

    作者:杨东靖;李力;吕莉琨;李佳萌;谭昭麟;苏旭

    目的 鉴定天津市手足口病病原体柯萨奇病毒A组2、4、5、6和10型,并分析其VP1区基因及分子流行病学特征.方法 提取45株非EV71非CV-A16肠道病毒分离株核酸,利用RT-PCR法扩增其VP1基因并测序,然后根据VP1区基因核酸序列,进行肠道病毒型别鉴定和同源性分析,构建种系发生树.结果 45株非EV71非CV-A16肠道病毒天津分离株分别为6株柯萨奇病毒A组2型(Coxsackie virus A2,CV-A2),14株CV-A4,3株CV-A5,8株CV-A6和14株CV-A10.柯萨奇病毒各型的株间核酸序列同源性均在80%以上,各型分离株与原型株的同源性均在71.2% ~ 85.8%之间.天津各型分离株在种系发生树上均聚集于各自相对独立的分支,与国内流行株处在同一分支内,而与国外原型株处于不同的进化分支.结论柯萨奇病毒A组2、4、5、6和10型成为天津市手足口病的流行病原体,各型天津分离株株间核酸序列同源性较高,呈现一定的区域聚集性.

  • HPV16-E6/E7在尖锐湿疣患者癌前病变分级诊断中的作用分析

    作者:杨超;徐薇

    目的 评价HPV16-E6/E7在尖锐湿疣患者癌前病变分级诊断中的作用.方法 将2013年12月-2014年12月来本院就诊的100例尖锐湿疣患者作为研究对象,采集所有患者的宫颈口样本,利用进行26种HPV基因亚型检测以及HPV16-E6/E7的基因检测.根据HPV 16-E6/E7在不同病变分级中检出率的不同,分析其中临床诊断中的提示作用.结果 HPV总检出率为24.0%(24/100),其中高危型(HPV 16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV45)、低危型(HPV6、HPV 11、HPV40、HPV42、HPV44)和混合型(HPV 16和HPV11、HPV33和HPV40)检出率分别为17.0% (17/100),5.0% (5/100)和2.0%(2/100).炎症组、CIN组、癌症组HPV 16-E6检出率分别为5%、20%、30%,三者检出的差异显著(P<0.05);HPV16-E7检出率分别为50%、65%、79%,三者检出的差异有统计学意义(P<0.05).结论 HPV 16-E6/E7基因与宫颈疾病及其癌变的关系密切.

  • 乙肝病毒基因分型研究及应用进展

    作者:冼永超;程书权

    目前乙型肝炎病毒(HBV)感染依然是现阶段突出的公共卫生问题,有近4亿感染者为慢性HBV携带者,中国病例约占30%[1].HBV感染可导致急、慢性乙型肝炎,同时还是肝硬化及肝细胞癌的高危因素.如何有效控制HBV感染仍是一个国际性难题[2],而HBV基因类型的甑别则成为对HBV的研究热点.

  • 人乳头瘤病毒亚型检测技术研究进展

    作者:刘凤洁;沈汝桐

    人乳头瘤病毒(human papillomavius,HPV),属于乳多空病毒科的一种DNA病毒,是促使子宫内上皮样瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)及宫颈癌[1-4]发生的重要因素,越来越引起医学界的重视.在我国,宫颈癌严重威胁女性生命和健康,因此,对HPV感染的检测、基因分型对临床宫颈癌的防治具有重要意义.鉴于此,本文从HPV分型检测方法的角度出发,对HPV基因的检测和分型方法如核酸杂交、荧光定量PCR、基因芯片等,以及各方法的优缺点进行了系统的综述,以期进一步建立可靠、简便、快速的HPV检测、定量、分型方法.

  • 基因芯片技术在乙型肝炎病毒基因分型检测中的应用探讨

    作者:杨光;崔金环;司建华

    目的:探讨利用基因芯片技术建立乙型肝炎病毒基因分型诊断方法的可能性.方法:查阅国际上主要的乙型肝炎病毒(HBV)基因分型诊断标准和现行技术,通过将基因芯片技术与目前用于HBV基因分型的技术方法进行对比,探讨利用基因芯片技术建立乙型肝炎病毒基因分型诊断方法的可能性.结果:HBV的基因分型,既可通过全基因序列比对,也可通过片段基因序列比对,片段基因序列比对是实际工作中HBV基因分型的主要方法,现有报道的技术主要为型特异引物(SSP)PCR扩增法和PCR扩增型特异探针(SSO)杂交法.基因芯片技术具有高敏感、高通量和能够平行检测DNA类型等特点,技术类型属于PCR扩增型特异探针(SSO)杂交法.尚未见有应用基因芯片技术进行HBV基因分型检测的报道.结论:借鉴现有的PCR扩增型特异探针(SSO)杂交法,如微板核酸杂交-ELISA显色技术,理论上利用基因芯片技术建立乙型肝炎病毒基因分型诊断的方法是完全可能的,并且具有高效、快速和廉价等特点.

  • 戊型肝炎病毒基因型地域分布特征的演变

    作者:乔伟振;孟继鸿

    自Reyes1990年首次克隆出缅甸株HEV基因序列以来,国内外不同基因型的HEV毒株陆续被发现.科学家们对已分离的HEV毒株进行了全基因及部分基因的克隆及测序,借助于系统软件的分析对HEV进行了基因分型,发现在世界范围内HEV基因型地域分布特征发生了很多变化.本文回顾了HEV基因型地域分布演变的过程,概括了HEV基因型新的地域分布特征.

  • ERIC-PCR在肠道致病菌基因分型和流行病学中的应用

    作者:方伟;杨杏芬;柯昌文

    肠杆菌基因间重复共有序列PCR研究是分子流行病学分子分型方法的一种,根据所得数目不等、大小不同的各自独特的电泳带型来达到菌株分型的目的,近年逐渐引起了人们的关注.现已用于纯菌、人工混合菌和微生物群落的结构分析.本文对肠杆菌基因间重复共有序列PCR的基本原理、优缺点、发展概况及其在肠道致病菌基因分型和流行病学研究中的应用进行了简要.

  • 043 空肠弯曲菌分型方法研究进展

    作者:吴高林;袁宝君

    空肠弯曲菌是重要的人类肠道致病菌.随着近年分子生物学及相关技术迅猛发展使基于其基础上的各种空肠弯曲菌分型方法不断推陈出新,并因其分辨力、分型率、敏感性高于传统检测方法而越来越受到人们的重视.本文综述了空肠弯曲菌的传统检测方法及基因分型方法(RFLP分型、PFGE分型、AFLP分型、RAPD分型、MLST分型)的研究进展.

  • 间隔区寡核苷酸分型法用于99株结核分枝杆菌杭州临床分离株的基因分型研究

    作者:王勐;刘志广;赵秀琴;董海燕;刘洁;张媛媛;吕冰;万康林

    目的 用间隔区寡核苷酸分(Spoligotyping)鉴定杭州结核分枝杆菌临床分离株的基因分型种类和特征,为结核病防治研究提供基础科学依据.方法 收集结核分枝杆菌杭州临床分离株,应用Spoligotyping进行基因分型检测.基因聚类分析采用BioNumerics(Version 5.0)软件.结果 共在杭州市收集到99株结核分枝杆菌临床分离株,可分为2个基因群,即北京家族(Beijing family)和非北京家族(Non-Beijing family),分别占64.65%(64/99)和35.35%(35/99),20种基因型,其中9株为独特类型,剩余90株分为11簇.北京家族菌株中,89.06%(57/64)为典型北京家族(Typical Beijing family),35株非北京家族菌株可分为16个基因型,10株为独特的基因型.结论 杭州结核分枝杆菌存在明显的基因多态性,北京家族菌株占优势,但非北京家族菌株基因多态性更显著.

  • 原发性肝细胞癌与HCV分型的关系

    作者:王乃昌;闫建文;刘玉萍;吴立平

    了解原发性肝细胞癌(HCC)患者HCV基因型分布现状及其关系.选择山西省肿瘤医院1996年间住院的HCVRNA阳性、临床上确诊的HCC患者血清标本13份,非肝癌癌症患者血清标本15份,1996-1997年HCVRNA阳性的公共场所从业人员血清标本15份,用特异性引物进行RT-PCR基因分型.结果表明,13例HCVRNA阳性的HCC患者,除1例未能分型外,其余12例均为HCV 1b型(100%).15例非肝癌癌症患者,除13例(86.67%)为1b型感染者外,其余均为2a型(13.33%).15例从业人员中,不仅检出了1b型感染(86.67%),还检出2a型、1/2混合型各1例.所有标本中1b型、2a型、1b/2a混合型的构成分别为38/42(90.48%)、3/42(7.14%)、1/42(2.38%),以1b型的比例高,未检出1a、2b和3a型.证明HCVRNA 1b型与HCC的关系较为密切,同时也是山西地区HCV感染的优势株.

  • 2016年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒感染状况及其基因型别特征

    作者:纪蕾;陈莉萍;沈月华;严伟;吴晓芳;徐德顺;朱晓娟;查赟峰

    目的 调查浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒的感染状况、基因型别及其动态变化趋势.方法 于2016年采集湖州市食源性疾病主动监测哨点医院的急性胃肠炎病例粪便标本.采用特异性引物探针,应用real-time RT-PCR对标本进行诺如病毒核酸检测.同时对阳性标本衣壳蛋白基因片段进行扩增和测序,结合在线分型工具和序列系统进化分析诺如病毒基因型别.结果 501份急性胃肠炎患者粪便标本检出诺如病毒阳性101份,阳性率20.16%,以GⅡ基因组为主(86.14%);男性检出率为20.75%(50/241),女性检出率为19.54%(51/260),差异无统计学意义.不同年龄段病例均检出诺如病毒,<5岁儿童检出率高.诺如病毒感染全年均有发生,但6-9月呈低流行状态.2016年湖州市流行的诺如病毒基因型别多样,包括GⅡ.17、GⅡ.4 Sydney_2012、GⅡ.3、GⅡ.13、GⅠ.6、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅠ.7共8种基因型别.GⅡ.17和GⅡ.4 Sydney_2012呈月份交替流行.结论 湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因型别多样,且呈交替流行现象,应进一步加强监测各型别诺如病毒在本地的流行范围及型别分布变化情况.

  • 2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染及基因特征研究

    作者:沈月华;纪蕾;陈莉萍;朱晓娟;查赟峰;徐德顺;吴晓芳

    目的 了解2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染状况及基因特征,为加强感染性腹泻监测与综合防控工作提供依据.方法 收集2014年湖州市综合性三级乙等和二级甲等各一家医院的粪便标本797份,采用实时荧光定量PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对诺如病毒核酸阳性标本进行衣壳蛋白区的序列测定和分析.结果 797份粪便标本中149份检出诺如病毒核酸阳性,阳性率18.70%(149/797),以GⅡ基因型为主,占89.26% (133/149).衣壳蛋白区序列的系统进化分析显示检出的诺如病毒有5种GⅠ型别和7种GⅡ型别,包括GⅠ.1、GⅠ.2、GⅠ.5、GⅠ.6、GⅠ.7、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.17、GⅡ.21,以GⅡ.4 Sydney_2012(55.5%)、GⅡ.17(25.5%)型为主.结论 诺如病毒在湖州市急性腹泻患者中存在较高感染,并且基因型别复杂,除了流行优势型别GⅡ.4外,2014年底还出现GⅡ.17型诺如病毒的流行,因此应加强诺如病毒腹泻监测工作,为今后疫情防控提供科学依据.

  • 杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒感染的流行病学及基因特征分析

    作者:文艳苹;于新芬;周银燕;寇宇;郑伟;郑之北

    目的 了解杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPyV)流行特征和基因型别.方法 收集2011年3月至2013年6月间至浙江省儿童医院就诊的急性呼吸道感染患儿的鼻咽吸取物,用聚合酶链反应(PCR)法扩增VP2编码基因和VP2/1中间序列,测序后进行分型.选取代表性病毒株进行基因组测序.结果 收集的722份标本中,10份为WUPyV阳性,检出率为1.4%.WUPyV感染主要发生在夏季、秋季和冬季.患儿平均年龄为13.6月龄,男女性别比为9∶1,性别差异无统计学意义(P=0.09).WUPyV感染所致疾病为肺炎、喉炎和细支气管炎.WUPyV基因型别为Ⅰa型.代表性毒株HZ13024的基因组大小为5229 bp,与GenBank中WUPyV基因组序列相似性为99.8%~99.9%.结论 杭州市儿童急性呼吸系统疾病中存在WUPyV感染,感染率较我国其他地区低,基因型别为Ⅰa型.

  • 结核分枝杆菌单核苷酸多态性特征的分析

    作者:陈海霞;贾俊楠;李卫民;高基民

    目的 通过全基因组序列分析结核分枝杆菌(MTB)单核苷酸多态性(SNP)特征,为结核病的预防、控制及治疗提供参考依据.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)和欧洲核酸数据库(ENA)中共下载来自全球2 372株MTB全基因组序列,原始数据按照质控要求去除冗余,BWA v 0.7.12软件将菌株的测序文件回帖到结核杆菌参考基因组H37Rv上;SAMtools v 1.3、Picardv 1.112、Varscan筛选SNPs位点以及去除非特异性SNP位点;采用大似然法软件RAxML v 8.2.8构建系统进化树;Genepop v 4.5.1软件计算每个SNP位点的遗传分化系数(Fst);SnpEff v 4.3c软件注释.结果 初步筛选得到107 654个SNP位点,构建的系统进化树将2 347株MTB明确地划分为7个谱系以及69个亚谱系.优化后得到285个谱系定义的SNP位点,将2 347株MTB准确划分为7个分支及67个亚谱系.结论 本研究通过基因组序列分析发现一批基于系统进化的SNP位点,而且基于系统进化285个SNP位点不仅可以用于系统发育及进化相关分析,同时也能够作为基因分型技术靶标,用于结核病分子流行病学.

  • 福建省长乐市80株结核分枝杆菌临床分离株可变数目串联重复序列基因分型研究

    作者:连健

    目的 研究福建省长乐市结核分枝杆菌临床分离株的基因型构成、主要流行株及其相关传播流行特征.方法 选择15个可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTR),对来源于长乐市结核分枝杆菌的临床分离菌株DNA进行检测,检测结果使用BioNumerics 5.0软件进行聚类分析.结果 80株结核分枝杆菌被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ、Ⅷ7大基因群,以Ⅰ群为主,包含59(73.8%)个株菌;流动人口结核分枝杆菌基因群为Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ、Ⅶ、Ⅷ,常住人口为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅷ;流动人口与常住人口的结核分枝杆菌VNTR基因型存在一定差异,但均以Ⅰ群为主.Ⅰ群菌株耐药性与其他基因群的耐药性差异无显著统计学意义(P>0.05).结论 初步明确长乐市结核分枝杆菌菌株有7大基因群,存在明显的基因多态性,以Ⅰ群流行为主,应加强此群菌株流行的监控.

  • 浙江省湖州地区10680例女性人乳头瘤病毒感染及基因分型分析

    作者:李栋立;秦基取;钱福初;范晓娴

    目的 了解浙江省湖州地区女性人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)亚型分布状况及年龄相关性,为本地区女性宫颈癌的防治及HPV疫苗的研制提供科学参考.方法 收集2011年1月至2013年12月于湖州市中心医院就诊的10 680份女性宫颈脱落细胞标本,以基因芯片方法进行HPV-DNA亚型检测及统计学分析.结果 10 680份标本,检出HPV阳性标本2865例,感染率为26.83% (2865/10 680).亚型分布构成比排在前3位的分别为HPV16为17.52%(718/4099),HPV52为15.32%(628/4099),HPV58为12.42%(509/4099).高危感染占82.41% (2361/2865),低危感染占8.90% (255/2865),高低危混合感染8.69%(249/2865);<20岁年龄组3种感染类型感染率均高.感染亚型以单一亚型感染为主(69.56%),单一亚型感染率高的是45 ~ 49岁年龄组为77.56%,多重亚型感染率高的是<20岁年龄组为60.38%.结论 湖州地区门诊女性HPV感染率为26.83%,亚型以HPV16,18,52为主.20岁以下高感染率、高多重感染率说明HPV感染有低龄化多亚型化倾向,值得引起高度重视.

  • 2015年湖北省武汉市5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究

    作者:金晶;张业成;刘映乐;吴建国

    目的 调查2015年湖北省武汉市<5岁儿童病毒性腹泻的流行病学特征.方法 收集2015年武汉市儿童医院<5岁全部腹泻患儿粪便标本及相关临床信息,采用酶联免疫吸附试验检测A组轮状病毒(RV),PCR方法检测肠道腺病毒(AdV),反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测诺如病毒(NOV)、札如病毒(SaV)、B组和C组轮状病毒及星状病毒(AstV),利用巢式RT-PCR对轮状病毒进行G/P基因分型.分析病毒性腹泻病原分子流行特征.结果 2015年武汉市<5岁全部腹泻患儿3 009例,病毒性腹泻病例流行季节以RV为明显,9-11月病例数占阳性病例数的50.3%;NoV的流行高峰在9-10月,占阳性比例的40.9%.AdV占2.0%、AstV占1.8%,SaV、B组和C组RV未检出.病毒性腹泻的发病年龄主要为<2岁婴幼儿.RV毒株G型与P型血清型分型结果显示,G型与P型组合则主要以G3P [8]和GIP[8]为主,构成比分别为37.4%和17.9%.结论 武汉市儿童病毒性腹泻病例携带的病原体具有多样性,以RV为主,主要流行株为G3P [8].

  • 北京市丰台区诺如病毒暴发疫情的实验室鉴定及基因特征分析

    作者:秦萌;陆翌禹;封会茹;杨军勇;武庆瑞;余红;王兆娥;董晓根;李洁

    目的 对北京市丰台区2014年5-6月发生的3起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行病原体鉴定及基因分型.方法 采用实时荧光定量-聚合酶链反应法对62份病例标本进行诺如病毒核酸检测,阳性标本经反转录-聚合酶链反应扩增RNA多聚酶区部分序列,使用BioEdit及Mega 6.0软件对扩增序列进行同源性及进化分析.结果 36份标本中检出GⅡ型诺如病毒,阳性率为58.06%;序列分析表明幼儿园为GⅡ.7型,学校1为GⅡ.8型,学校2为GⅡ.6型.结论 诺如病毒是引起丰台区急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体,丰台区流行的诺如病毒基因型存在多样性.

  • 中国26省(直辖市、自治区)2011-2014年5岁以下儿童腹泻病例轮状病毒流行特征分析

    作者:耿启彬;赖圣杰;余建兴;张子科;杨婉琪;李中杰;吴建国;杨维中

    目的 了解我国5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒的流行特征.方法 在国内26省(直辖市、自治区)162家医院的门/急诊中开展腹泻监测,收集腹泻病例临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送92家网络实验室采用酶联免疫吸附试验(ELISA)、反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和巢式PCR等方法检测轮状病毒,并分析2011-2014年不同时间、不同地区5岁以下儿童腹泻患者中轮状病毒检出率以及不同基因型的变异变迁情况.结果 在19 849例儿童腹泻病例中,22.9%的病例检出轮状病毒,其中,1~2岁和6月龄至1岁儿童检出率高,分别为29.0%和26.1%.轮状病毒在水样便中检出率高,为26.2%.轮状病毒在冬季检出率高,为39.4%,夏季检出率低,为9.9%.轮状病毒在我国南部和中部地区的检出率高,分别为28.0%和27.0%.A组轮状病毒为常见的血清型,占95.1%,其中G9P[8]、G1 P[8]和G3 P[8]为常见,分别占39.5%、16.8%和9.9%.2011年以来,G9P[8]逐渐取代G1P[8]和G3 P[8]成为目前我国主要的流行株.结论 轮状病毒是我国5岁以下儿童腹泻的常见病原体,并且呈现明显的时间和空间流行特征,G9 P[8]为主要流行株.

2020 条记录 1/101 页 « 12345678...100101 »

360期刊网

专注医学期刊服务15年

  • 您好:请问您咨询什么等级的期刊?专注医学类期刊发表15年口碑企业,为您提供以下服务:

  • 1.医学核心期刊发表-全流程服务
    2.医学SCI期刊-全流程服务
    3.论文投稿服务-快速报价
    4.期刊推荐直至录用,不成功不收费

  • 客服正在输入...

x
立即咨询