首页 > 文献资料
-
HIV实验室检测研究进展和发展趋势
随着分子生物学技术的飞速发展,人类免疫缺陷病毒(HIV)的实验室检测技术也在不断更新.本文着重阐述了HIV血清学第四代检测试剂盒的特点,应用抗体亲和力技术估计发病率,荧光实时定量PCR技术的应用以及基因芯片技术的发展趋势.
-
基因芯片在毒理基因组学中的应用
毒理基因组学是一门由毒理学与基因组学相互交融而产生的新兴学科.其目的是运用基因组资源及技术探索并研究潜在的威胁人类健康或环境质量的毒物.基因芯片是主要的基因组资源.通过基因芯片技术,可以同时检测成千上万基因的基因表达变化,获得高敏感性、可监测的基因水平的毒性标志.本文将对基因芯片的原理及基因芯片在毒理基因组学中的应用作一介绍.
-
DNA芯片技术与SNP分析
基因芯片技术作为一种新兴的生物技术,近年来得到迅速发展,其应用具有巨大的潜力.单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大.本文主要介绍了DNA芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用.
-
DNA芯片技术及其在营养学中的应用
DNA芯片技术是近年来迅速发展起来的分子生物学技术,该技术在人类基因组计划、新基因克隆、疾病诊断等许多生命科学领域已得到广泛应用,并显示出快速准确、多功能、微型化和自动化等无可比拟的优点.营养学作为生命科学的重要分支之一,DNA芯片技术在营养学中也有着潜在的广泛应用前景.本文就DNA芯片技术的原理、主要流程、优点及在营养学中的应用前景作一综述.
-
130 基因芯片技术在卫生毒理学中的应用
基因芯片也称之为DNA阵列,或寡核苷酸阵列.基因芯片技术是同时将大量探针分子固定于支持物上后与标记的分子进行杂交,通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息.本文就这项技术在毒理学研究和危险评价中的应用作一探讨.
-
壬基酚致雄性仔鼠脑组织差异基因的表达
目的 应用基因芯片技术,检测壬基酚暴露对仔鼠脑组织差异基因的表达,筛选部分与神经毒性相关的差异表达基因及通路进行进一步机制研究.方法 建立孕期和哺乳期暴露壬基酚的仔鼠模型,提取暴露组和对照组出生21 d仔鼠脑组织mRNA,采用Roche Nimblegen公司生产的12 × 135位点的包含大鼠26 419个基因的表达谱基因芯片,检测脑基因的表达,扫描仪进行扫描及数据处理.结果 暴露组与对照组共有1 254个差异表达基因,其中619个基因上调,635个基因下调.部分与神经系统功能相关差异表达基因为:①神经营养相关的基因:甘丙肽基因下调,神经生长因子基因下调;②细胞凋亡的相关基因:凋亡蛋白酶活化因子-1基因上调,凋亡抑制基因-1基因下调,半胱氨酸蛋白酶7基因上调;③信号传递及离子通道相关基因的表达:谷氨酸盐受体基因下调,钙调素依赖性蛋白激酶Ⅱ基因下调.结论 壬基酚能导致仔鼠海马神经元信号传导、免疫应答、细胞凋亡、炎症反应因子、神经胶质细胞发育等相关基因的差异表达,以上改变有可能干扰神经系统的发育和功能.
-
利用基因芯片技术分析空肠弯曲菌的遗传特征
目的 为分析我国弯曲菌遗传特征,本研究根据已发表多株弯曲菌的全基因组测序特征及比对结果自行设计基因芯片,利用芯片对我国不同宿主来源菌株进行遗传特异性分析.方法 根据前期基因组水平比对分析的结果,利用Combimatrix tilingCustomArrayTM 90K芯片,设计DNA芯片.芯片包含已测序菌株ICDCCJ07001、269.97、NCTC11168、81-176、81-116和RM1221共3384个CDS的探针序列,以及空肠弯曲菌耐药及致病性相关2个质粒共80个CDS的探针序列,与脂寡糖的合成相关基因簇16种共219个CDS的探针序列、荚膜多糖合成相关基因簇7种共160个CDS的所有序列.对我国不同宿主来源27株分离菌株提取DNA,利用芯片进行杂交,获得杂交信息并分析不同菌株CDS分布特征分析及聚类特点.结果 中国菌株的主要变异区域主要存在于与脂寡糖、荚膜多糖合成相关的基因簇、鞭毛修饰相关的基因簇、DNA限制/修饰相关的基因簇以及空肠弯曲菌Mu样噬菌体基因簇.基因组水平不同来源菌株CDS分布的聚类结果没有发现显著的宿主归因特点,但GBS相关菌株脂寡糖合成相关基因组成具有共性特征.结论 通过验证以及与过去研究的比较,本次研究中的基因芯片技术结果准确可信,本研究所用基因芯片在分析空肠弯曲菌基因多态性方面具有很好的优势,可用于弯曲菌遗传特征和重要毒力因子的分析和检测.
-
基因芯片技术在中药研发中的应用
中药成份复杂、作用靶点不明确、重现性差,而基因芯片作为一种高通量、大规模研究基因功能的新技术,能够从分子生物学水平上阐明中医药治病的机制,在中药药理分析、新药研制开发、中药鉴定、毒理观察等中药现代研究中展示出良好的应用前景.
-
食品致病菌检测中基因芯片技术的应用
本文对食品致病菌检测方法进行分析,总结运用基因芯片技术的价值,旨在通过方法探究来提高食品致病菌检测的准确性和高效性,推动检测技术进一步提高,并促进食品产业的稳定发展.
-
现代分子生物学技术在食品和药品微生物检测中的应用
在我国药品、食品行业急速发展的社会形势下，食品、药品的质量与人们生命健康息息相关，然而我国当前使用的食品、药品检测手段还不够先进，因此，发展一项新的食品、药品检测技术具有现实性。本文首先详细分析了聚合酶链式反应技术的原理、应用及前景，接着简要介绍了变性梯度凝胶电泳技术、基因芯片和现代免疫技术。
-
妊娠与未妊娠患者超排卵周期第10天子宫内膜基因表达差异分析
目的 对内膜修整后所取得的内膜组织按妊娠结果的不同分组进行分子水平的分析和检测,寻找合适的内膜发育分子标志物,早期预测辅助生殖技术(ART)患者的妊娠结果. 方法随机选择10例接受增殖期子宫内膜修整术患者,其B超及组织学检查结果表明内膜处于相同发育阶段,按妊娠结果分为妊娠组与未妊娠组,抽提每例的子宫内膜组织总RNA,4例妊娠患者和3例未妊娠患者的内膜组织RNA符合芯片检测要求,使用Affymetrix U133 plus 2.0基因芯片进行表达谱分析.结果 妊娠组与未妊娠组子宫内膜组织具有218个差异表达基因(≥2倍),其中177个基因在未妊娠组高表达,41个基因在妊娠组高表达.差异基因主要涉及代谢、细胞通讯和胞内过程调控等生物学过程,参与离子结合、信号传导和物质转运等重要功能.结论 妊娠组与未妊娠组的增殖期子宫内膜细胞表达在转录组水平上差异明显,某些重要差异表达基因(LAMA4、integrin α 6和MMP1)有可能成为便利的早期预测ART患者妊娠结果的分子标志物.
-
铅暴露U251细胞对钙离子信号通路的影响
目的 探讨铅暴露人神经胶质瘤U251细胞对钙离子信号通路的影响.方法 将体外培养的人神经胶质瘤U251细胞(human U251 glioma cells,U251)分别暴露于含有乙酸铅(400μg/ml)的培养液中8和24 h,提取RNA.应用cDNA芯片技术筛选差异表达基因,并利用信息学技术进行钙离子信号通路分析.结果 铅暴露U251细胞,导致2840条基因差异表达,钙离子信号通路中有45条基因表达异常.结论 铅暴露U251细胞后,参与钙离子信号通路的45条基因发生了表达改变,导致细胞膜上钙离子通道发生变化,钙离子调控的生物学功能受到影响.
-
光气致急性肺损伤下调差异基因的初步筛选
光气作为重要的化工原料,在生产和使用中由于防护不当经常发生急性中毒.光气的主要毒性作用是引起肺水肿,出现气道功能和结构的改变.迄今对光气中毒肺水肿的中毒机制见解不一,临床诊治亦无特效措施[1,2].本研究从对维持正常肺功能发挥重要作用的肺泡Ⅱ型上皮细胞(AT-Ⅱ细胞)入手,利用基因芯片技术,从分子水平探讨光气中毒损伤的基因改变,为进一步研究光气中毒机制提供新线索,同时为临床诊治探讨新思路.
-
三价铬对体外培养成骨细胞基因表达的影响
目的 了解三价铬对体外培养成骨细胞差异基因表达谱,探讨三价铬毒理机制.方法 基因芯片筛选受三氯化铬溶液(10 mg/L)作用24 h前后的成骨细胞hFOB 1.19基因表达谱.并对部分差异基因表达以实时荧光PCR技术验证.结果 10 mg/L的三价铬作用成骨细胞24 h后,基因芯片结果示差异基因2 811个,其中上调基因1 503个,下调基因1 308个(P<0.05),有显著性差异变化的细胞功能涉及增殖、凋亡、基因表达调节、免疫等.实时荧光PCR结果验证了Card11、Igsf6、Tnfrsf17和Rora基因在三价铬(10 mg/L)作用72 h后表达显著增高.结论 在本试验条件下,成骨细胞在体外受三价铬(10 ms/L)刺激后涉及的生物效应主要有炎症反应和细胞凋亡.新报道4个基因受三价铬(10 mg/L)激活,其可能通过对细胞免疫反应、凋亡的调节而参与三价铬生物效应,具体作用通路仍需进一步研究.
-
口腔黏膜白斑(OLK)癌变驱动基因研究
目的 筛查与口腔黏膜白斑( Oral leukoplakia,OLK)癌变相关的表达阳性基因,为探究口腔鳞状上皮细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的发生机制奠定基础.方法 采用美国SuperArray公司的肿瘤基因芯片(OHS802)检测OLK组织和OSCC组织的440个肿瘤相关基因表达差异,进一步使用RT-PCR法对部分阳性基因进行验证,寻找OLK恶变发生、发展相关的基因.基因芯片实验参考文献方法进行.RT-PCR电泳结果采用Kodak凝胶成像分析系统对部分基因的表达水平进行定量,然后将其与芯片分析的数据结果进行相似性分析.结果 经Kodak凝胶成像分析系统定量后,证实OLK组织和OSCC组织间CLK-3、CTNNB-1、GDF-15、FKBP-8、SOCS-3、NF-1、BCL-2、XRCC-1、ACP-2 9个SupperArray阳性基因的RT-PCR结果,在表达水平上和SupperArray芯片检测方法获得的结果差别均有统计学意义(P＜0.05).结论 OLK癌变的分子机制较为复杂,特别是与细胞周期调控基因、生长因子基因和细胞增殖分化基因关系密切.
-
三氧化二砷对小鼠小脑氧化还原相关酶基因表达谱的影响
目的 应用基因芯片技术观察三氧化二砷(As2O3)对小鼠小脑组织氧化还原相关酶基因表达谱的影响.方法 昆明种小鼠30只随机分为3组,即生理盐水对照组、低剂量组(1 mg/L As2O3染毒组)和高剂量组(4 mg/L As2O3)染毒组),连续染毒60 d,断头法处死小鼠,利用基因芯片技术检测基因表达谱的变化.结果 基因芯片筛选结果显示,与对照组比较,染砷组中差异表达2倍及以上的基因有18条,其中表达上调的基因有12条,表达下调的基因有6条.高剂量组与低剂量组及对照组比较,表达上调的基因有Ndufa4、Ndufa6、Gpx3、Adil、Rrm2b,表达下调的基因有Spr、Hsd17b11、Ogfod1、Ndufab1.与对照组比较,染砷组中Cyp51、Phgdh、Dhrs4、Prdx4、Aldh1a、1810063805Rik、Glrx表达上调,Prdx2、1110020P15 Rik表达下调.结论 As2O3对小鼠小脑的氧化还原相关酶基因表达谱具有明显的影响,提示这些小脑氧化还原相关酶基因很可能是砷的神经毒作用的靶点.
-
氯化镉在Balb/c 3T3细胞转化过程中对细胞凋亡的影响
目的 探讨氯化镉(CdCl2)在Balb/c 3T3细胞转化过程中对细胞凋亡的影响及其分子机制.方法 N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(MNNG)启动后,CdCl2持续处理Balb/c 3T3细胞14 d,建立两阶段细胞转化模型.苔盼蓝排染法检测CdCl2的细胞毒性,Annexin V-HTC/PI双染色结合流式细胞仪检测细胞凋亡率,小鼠毒理基因芯片检测CdCl2促癌作用过程中的基因表达变化.结果 1 mg/L MNNG启动后,324 μg/L CdCl2持续处理能诱导细胞转化灶的出现.CdCl2处理2 d后细胞存活率降低,凋亡率显著升高.同时基因表达谱分析筛选出的差异表达基因中,有11个基因的功能与细胞凋亡有关,10个基因的功能与细胞抗氧化机制有关.结论 CdCl2在促癌过程能诱导Balb/c 3T3细胞凋亡,同时影响凋亡和抗氧化相关基因的表达.
关键词： 细胞凋亡 细胞转化 Balb/c 3T3细胞 氯化镉 基因芯片 -
毒理基因组学在肾毒性研究中的应用进展
肾脏是体内重要的排泄器官,也是外源性毒物在体内的主要代谢器官之一.很多化合物(药物)进入体内可引起肾脏损伤.国内外学者利用体内或体外模型对肾毒性作用及其机制进行了研究[1].近年来,毒理基因组学(toxicogenomics)的快速发展对毒性评价的模式、毒理学的研究方法产生了巨大影响.在肾毒性标志基因的鉴别、化合物肾毒性的量效关系、毒作用机制研究及肾毒性预测等方面,毒理基因组学已经提供或正在提供有价值的信息.现就毒理基因组学在肾毒性研究中的应用进展作一综述.
-
基因芯片筛选二羟环氧并芘转化支气管上皮细胞相关基因的研究
目的应用基因芯片技术筛选二羟环氧苯并芘(BPDE)转化细胞的相关基因,探讨基因芯片技术高通量筛查在细胞、分子毒理学研究中的应用价值.
-
二羟环氧苯并芘诱发细胞恶变后基因和蛋白表达差异分析
目的研究苯并(a)芘代谢产物反式二羟环氧苯并芘(反式-BPDE)诱发人支气管上皮细胞系(16HBE)恶性转化的基因和蛋白表达的改变,探讨苯并(a)芘致癌的分子机制.
