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我国607株不同宿主来源弯曲菌耐药基因簇aadE-sat4-aphA-3分布分析
目的 了解不同宿主来源弯曲菌对氨基糖苷类抗生素的耐药现状,确定耐药菌株中氨基糖苷类耐药基因簇aadE-sat4-aphA-3的分布,并初步了解耐药菌株的菌型特征.方法 利用琼脂稀释法分析不同宿主来源菌株针对链霉素小抑菌浓度(MIC),对耐药的221株菌通过聚合酶链反应筛查氨基糖苷类耐药基因簇aadE-sat4-aphA-3的分布情况.选取不同来源共100株耐药菌株进行多位点序列分型分析并进行聚类分析,获得耐药菌株的菌型特征及遗传相关性.结果 607株弯曲菌中共筛查到221株(36.41%)链霉素耐药株(MIC≥4 μg/ml),其中腹泻患者来源菌株耐药率33.33% (78/234)、鸡来源菌株耐药率35.14%(123/350)、猪来源菌株耐药率86.96%(20/23).空肠弯曲菌耐药率14.37%(51/355),结肠弯曲菌耐药率67.46%(170/252).24株(10.86%)链霉素耐药弯曲菌中筛查到aadE-sat4-aphA-3耐药基因簇,分别来自腹泻患者14株、鸡4株、猪6株.100株耐药菌株共分为58种ST序列型.结论 结肠弯曲菌链霉素耐药率明显高于空肠弯曲菌,猪源弯曲菌耐药率显著高于人源和鸡源,空肠弯曲菌与结肠弯曲菌中均筛查到aadE-sat4-aphA 3耐药基因簇.
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不同种红曲霉产桔青霉素研究进展
介绍了不同种红曲霉在工业中的应用和产桔青霉素情况.分析桔青霉素的合成代谢途径,并比较了目前已报道的紫色红曲霉、红色红曲霉及橙色红曲霉桔霉素合成基因簇的差异,对不同种红曲霉桔青霉素合成关键基因的分布进行总结.综述了基因组学和转录组学在红曲霉中的应用,提出了目前对于不同种红曲霉产桔青霉素研究亟待解决的科学问题.
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红曲霉中桔霉素定量分析及其合成相关基因簇的研究
目的 对红曲霉中真菌毒素桔霉素进行定量分析,并研究桔霉素合成相关基因簇,为从基因水平上对桔霉素的产生进行调控、提高红曲霉相关食品的安全性提供理论依据.方法 采用高效液相色谱(HPLC)法对3株红曲霉(紫色红曲霉YY-1、M2,丛毛红曲霉FJ-1)在液态发酵过程中产生的桔霉素开展定量分析,采用二代测序技术鉴定桔霉素合成基因簇的序列特征,应用实时定量聚合酶链式反应(RT-PCR)法进行相关基因表达水平分析.结果 在固态培养和液态发酵过程中,3株红曲霉菌体生长情况无明显差异;在液态发酵过程中,HPLC结果显示M2桔霉素产量高,其次为YY-1,F J-1产量少;M2、YY-1、F J-1桔霉素合成基因簇相似度达99.9%;膜转运蛋白基因(orf5)、聚酮合酶基因(pksCT)、氧化还原酶基因(ctnB、转录调节蛋白基因(ctnA)、脱氢酶基因(orf1、ctnE)六个基因表达水平在M2中高,在FJ-1中低.结论 桔霉素的产量差异与桔霉素合成基因簇所表达酶的种类无关,而与其基因表达的调控相关.
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基因间长非编码RNA在T细胞发育分化过程中的表达和调控
虽然基因间长非编码RNA(intergenic long noncoding RNA,lincRNA)在不同组织中都与基因调节有关,但是我们对T细胞系中的lincRNA所知尚少。作者用高通量测序手段在从早期T细胞到辅助体细胞的42种T细胞中发现了1524个lincRNA基因簇,其中某些基因簇甚至能够表达至少两个lincRNA。文中研究发现lincRNA在T细胞分化过程中呈现高动态和高细胞特异性的表达模式。其中,LincR-Ccr2-5'AS不仅可以调控CCR1、CCR2、CCR3、CCR5等多种共表达基因,还可以在小鼠体内调控Th2向肺部的迁移。该研究对T细胞lincRNA进行了高通量测序,丰富了免疫学非编码RNA数据库,并进一步研究了lin-c RN A对免疫功能的调控,为免疫学领域的非编码RN A相关研究做出了贡献。
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格林-巴利综合征空肠弯曲菌的wla基因簇序列对比研究
格林一巴利综合征(Guillain-Barre syndrome,GBS)是发生于空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)感染后的脱髓鞘性周围神经病,根据病理生理表现的不同,GBS可分为急性炎症性脱髓鞘性多发性神经病(acute demyelinating pattern,AIDP)、急性运动轴突型神经病(acute motor axonal neuropathy,AMAN)及Miller.:Fisher综合征.我国常见的GBS类型为AMAN,其电生理改变及病理表现为轴突损害.大量研究表明,空肠弯曲菌感染后引起的细菌脂寡糖(1ipooligosaccharides,LOS)与周围神经中神经节苷脂的交叉免疫反应可能与GBS的发病有关[1].LOS编码区的突变和变异极其活跃,这种突变和变异有利于细菌逃避宿主的免疫反应.但由于LOS结构的变化,同时也导致了菌株致GBS能力的改变[2].wla基因簇编码的多种蛋白质参与了细菌表面LOS的生物合成[3],本文对3株致AMAN型GBS空肠弯曲菌菌株的wla基因簇进行扩增及测序,通过与已知空肠弯曲菌菌株的相应序列进行对比及分析,观察其序列特征及与致GBS的相关性.
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α地中海贫血的基因诊断方法
α地中海贫血是世界上常见的血液系统遗传病之一,该疾病是由于α珠蛋白的基因缺失或功能障碍,导致α珠蛋白肽链合成减少或不合成引起.该病高发于从地中海沿岸的意大利、希腊、马耳他、塞浦路斯到东南亚各国的广大地区.我国南方也是本病的高发地区[1-2].人类的α珠蛋白基因位于第16号染色体短臂末端的α珠蛋白基因簇中,该基因簇包括2个重复的α基因(α2和α1)、一个胚胎期类α基因(ζ2)、三个假基因(ψζl、ψα2、ψα1)和一个功能未名的θ1.其排列顺序为5'-ζ2-ψζ1-ψα2-ψα1-α2-α1-θ1-3'.
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冠心病患者载脂蛋白基因变异的检测和临床应用研究
载脂蛋白(apo)基因变异(多态性)是冠心病及其质代谢紊乱的重要遗传背景.apoE基因位于人类19号染色体p13~q13(19q13.2)与apoC-Ⅰ/C-Ⅱ基因组密切相邻[1].而Bruns等[2]发现apoA Ⅰ-CⅢ基因簇位于11号染色体,Karathanasis等[3]发现apoA1/C3/A4基因簇的多态性与血脂及动脉粥样硬化有关,apoA5是近来发现的载脂蛋白,被确定与血浆甘油三酯水平密切相关[4-5].apoH基因位于17号染色体,是血浆脂蛋白组成之一,可与富含甘油三酯的脂蛋白共同沉淀,而富含甘油三酯的脂蛋白是动脉粥样硬化的独立标志之一,因而也可能为冠心病遗传标记.作者通过对同一组样本进行多个位点的载脂蛋白基因变异检测,建立了分子实验方法、探讨临床实用性.
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TNF-α基因多态性对肝炎及其他感染性疾病的影响
TNF-α是一种有效的炎性细胞因子,人类TNF-α基因位于高多态性的MHC复合体区(6p21.3),TNF基因簇内有很多微卫星多态性及单核苷酸多态性(SNPs),其中很多多态性与HLA Ⅰ、Ⅱ类等位基因之间存在连锁不平衡.体外实验发现有些TNF-α基因的多态性可影响TNF-α的产量,并与病毒性肝炎及其他感染性疾病的易感性有关,这种现象是由这些多态性直接引起的,还是因为与TNF-α基因或HLA基因的其他多态性连锁并协同发挥作用,尚需进一步研究.
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miR-17-92基因簇在肿瘤发生发展中作用的研究进展
肿瘤是威胁全世界人类健康和影响社会经济的重要因素.近年来,随着经济的发展,肿瘤的发病率呈明显上升趋势,但是其病因尚未完全阐明.越来越多的证据显示肿瘤的发生和遗传因素有关,随着病理生理学和遗传学的发展,许多学者认为生物标志物可以预测癌症甚至指导临床治疗.微小RNA(microRNA,miRNA)是非编码小分子RNA,在发育、生理、病理过程以及肿瘤发生等环节中起着重要的调节作用.miR-17-92基因簇是研究较为深入、有特点的miRNA,被认为是原癌基因mi RNA的代表,在多种肿瘤的发生发展中起着至关重要的作用.本文就miR-17-92基因簇在肿瘤发生发展中的作用及功能进行综述.
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染色体现9P21区段抑癌基因簇的表达异常与胆管癌生物及临床特点的关系
目前已经发现在9P21区段有P14/ARF、P16/INK4A、P15/INK4B等抑癌基因,它们的位置非常邻近,并且有部分重叠,构成了一个重要的抑癌基因簇.我们试图通过检测在胆管癌组织中这三个基因的异常表达,初步探讨其在胆管癌发生发展中所起的作用.
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脊髓性肌萎缩症SMN1基因携带者筛查技术研究进展
1 背景介绍脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy,SMA)是全球常见的致死性常染色体隐性遗传疾病之一,活婴发生率为1/5000~1/10000,人群携带率为1/35~1/50[1].临床上根据SMA发病年龄和病程的不同,将患者分为Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型及Ⅳ型,其中占患者比例约70%的工型临床表型为严重,常于6个月内起病,多数于2岁内夭折[2].1995年,SMA相关基因被定位于5号染色体长臂1区(5ql1.2~13.3),并发现了反向重复的运动神经元生存基因(survival motor neuron,SMN)[3].该基因有2个序列高度相似的拷贝:靠近端粒的决定性基因SMN1及靠近着丝粒的修饰SMN2,两者之间仅存在5个碱基的差异,而在编码区内只存在1个碱基的差异,即第7号外显子上的840C>T.由于SMN所在的染色体区域存在众多重复和假基因簇等易导致结构不稳定的序列,导致SMN基因发生缺失或转换的频率较高,相应的表现为人群SMN基因拷贝数组合复杂多变.
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062变应性鼻炎相关基因的研究进展
变应性鼻炎属于鼻部变态反应性疾病,受到多个基因的遗传控制.对该病的致病基因的研究是近年来的研究热点,已经发现有多个与它相关的候选基因区,如与IgE水平相关的11q13区和细胞因子基因簇5q31及12q,以及发现有关的核因子NF-κB、激活蛋白AP-1、组胺受体及相关基因、5-脂氧合酶(ALOX5)、抗血管紧张转换酶ACE、内皮素ET-1基因等参与变态反应,同时在一些基因中发现与该病有关的突变,并进一步探讨了这些候选基因在疾病的发病机制中的作用.本文就近年来的研究进展作一综述.
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耐万古霉素肠球菌耐药机制的研究进展
自20世纪80年代后期发现第一株耐万古霉素肠球菌(VRE)以来,糖肽耐药性肠球菌的数量不断增多,甚至出现了其耐药性向其他细菌转移的严重现象。VRE耐万古霉素机制的分子生物学研究表明,VRE对万古霉素的耐药性多数是由位于染色体或质粒上的耐药基因簇引起的。根据对万古霉素和替考拉宁的耐药水平及耐药基因簇的差异,可将糖肽耐药性肠球菌分为VanA,VanB,VanC,VanD,VanE和VnaC等6种基因型。本文将着重介绍VRE耐万古霉素的分子生物学机制,以及目前对VRE感染的治疗策略。
关键词: 万古霉素 耐万古霉素肠球菌 耐万古霉素肠球菌感染 基因簇 -
组合生物合成聚酮类药物研究进展
在筛选和发展新型微生物药物方面组合生物合成日益成为生物、化学和医药界关注的重点.基于聚酮类(PK)天然产物的独特化学结构和良好生物活性,研究它们的生物合成机制,将为合理化遗传修饰生物合成途径获得结构类似物提供遗传和生物化学的基础,实现利用现代生物学和化学的技术手段在微生物体内进行药物开发的目的.现综述近年来组合生物合成技术的基本原理、聚酮合酶的基本作用机制以及合成途径的改造情况等.
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建立α与β珠蛋白基因簇转基因鼠模型及β基因族反式因子研究
随着人类功能基因组研究的广泛开展,理解基因组中的遗传信息如何协调、有序地调控细胞分化与个体发育的时空过程成为研究的基本问题,阐明这一机制是真核基因表达调控研究的根本任务.
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BAC介导的含97kb人β类珠蛋白基因簇转基因鼠模型的建立
目的利用RecA蛋白介导的同源重组的方法,修饰含全长人β珠蛋白基因簇及一段IL-11受体α链基因的BAC(细菌人工染色体)克隆,建立只包括全长人β珠蛋白基因簇的转基因鼠模型.方法分别在待删除片段上、下游用PCR合成500bp左右的两段同源序列,共同克隆入构建载体pBV的HindⅢ和Xba Ⅰ位点之间,然后以 Sal Ⅰ酶切后将此1 kb的插入片段再克隆入温度敏感型穿梭载体pSV-RecA中,转化含B5-BAC DNA的感受态大肠杆菌DH10B,经氯霉素正筛选和镰孢菌酸(FA)负筛选,获得发生两次同源重组后只含修饰后的BACDNA 而穿梭载体已丢失的菌株.经脉冲场凝胶电泳鉴定后,纯化修饰的BAC DNA,经显微注射受精卵制备转基因鼠,分析其中的人β珠蛋白基因簇整合和表达状况.结果利用RecA蛋白介导的同源重组的方法,获得了IL-11受体α链基因被定位删除的含完整人β珠蛋白基因簇的BAC克隆(命名为βD-BAC),建立了 3株独立的转基因鼠株系.结论新的BAC介导的转基因鼠中的人β珠蛋白基因簇显示正确的表达模式和水平.
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毒隐翅虫素生物合成的分子基础
毒隐翅虫素(pederin)是毒隐翅虫属昆虫在体内生物合成的一种动物毒素,用以抵御天敌.Pederin接触到人或动物的皮肤时可引起线性皮炎,pederin可抑制细胞的有丝分裂,阻碍蛋白质与DNA的生物合成,在癌症治疗与细胞生物学研究方面具有重要意义.目前认为pederin可能是通过两条途径合成,现就此两条合成途径进行详细的介绍,但其中的部分基因簇及基因迄今仍不为所知.
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科学家发现影响智商的基因
英国帝国理工学院研究人员首次确认人类大脑中两个与智商有关联的特定基因簇,这一发现不但加深了研究人员对智商的理解,未来或许有助于开发更高效的神经系统疾病疗法。
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用于转基因调控研究的人类ApoAI-AIV全基因簇克隆
目的克隆人类ApoAI-AIV全基因簇用于转基因调控研究ApoAI的刺激表达药物.方法使用平均克隆长度为38kb的人Cosmid基因组文库,通过制备逐级降低独立克隆数的文库亚库,以PCR对亚库中的ApoAI-AIV全基因簇首尾特征序列扩增作为亚库筛选性指标,筛选出独立克隆数约为10数量级的文库亚库,进行平板单克隆菌落筛选.结果得一个阳性克隆,其首尾特征序列经测序与公布序列相同.结论快速筛选获得人类ApoAI-AIV全基因簇的克隆.
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miR-17-92启动子区多态性在广西人群中分布及与淋巴细胞关系
目的:研究广西人群中miR-17-92基因簇启动子区rs9515692C/T和rs1352743A/G多态性分布特点和在不同人群间分布差异,探讨其多态性和淋巴细胞的关系.方法:采取多重单碱基延伸法(SNaPshot)和DNA测序法进行基因分型.运用流式细胞仪检测淋巴细胞数.数据分析利用SPSS17.0统计学软件.结果:2位点基因型及等位基因频率在广西人群的不同性别间差异无统计学意义(P>0.05).rs9515692C/T和rs1352743A/G基因型及等位基因频率与国际人类基因组单体型图计划(HapMap)公布的欧洲、日本和非洲人群的比较差异有统计学意义(P<0.05).结论:rs9515692C/T和rs1352743A/G基因多态性在不同人群中存在着不同程度差异.此外,rs9515692C/T多态性与B淋巴细胞数有关.