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基于生物学信息分析及推测PCGEM1在前列腺癌中的表达分子调控网络
非编码 RNA,包括以 miRNA、siRNA 和 piRNA 等为代表的短小 RNA 和长链非编码 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。长链非编码 RNA,有别于其他小分子非编码 RNA,是目前非编码 RNA 研究的热点。随着研究的不断推进,人们发现 lncRNA 与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等都有着密切的联系[1]。miRNA 是一类长度为21~25个核苷酸(nt)的单链 RNA,属于非编码蛋白 RNA,广泛存在于生物界,miRNA 调节人类1/3基因的表达,miRNA 是一类新发现的基因调节剂,可以在转录水平或转录后水平调节基因的表达,在肿瘤的发生与发展中扮演着“癌基因”与“抑癌基因”的角色[2]。前列腺癌基因表达标记1(prostate cancer gene expression marker 1, PCGEM1)全长1643 nt,在前列腺组织及前列腺癌组织中呈特异表达的长链非编码 RNA,但其表达调控网络目前未知[3],本文旨在运用生物学软件对其进行生物学信息分析,为下一步实验验证其表达分子调控网络机制提供线索。
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同一代谢通路上基因表达相关性分析
基因芯片技术是近年来发展起来的一种可以快速、高通量的探测基因在同一时刻表达水平的新技术.可用于研究生命体系中不同部位、不同生长发育阶段的基因表达,研究比较正常和疾病状态下基因表达及其表达的差异等.人们已经发展多种方法[1],包括多元统计分析、机器学习方法和模式识别方法等研究分析基因表达谱数据,探测基因表达调控网络及与疾病发生发展的关系等.