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2009年至2011年新甲型H1N1流感病毒HA基因同源性比较与进化分析

邹伟华;崔大伟;吴英萍;郑书发;何丽;许世佳;余斐;秦志梅;李游江;陈凌晓;陈瑜

摘要: [目的]分析杭州市2009年1月至2011年1月新甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)的基因序列,探讨该病毒的遗传变异和分子特性.[方法]应用RT-PCR的方法从临床标本中扩增新甲型H1N1流感病毒HA基因片段并测序.利用DNAMAN和Sequencher4.7软件对HA基因序列进行分析,比较HA基因氨基酸亲缘系数并绘制进化树.[结果]成功地对15例新甲型H1N1病毒的HA基因进行扩增并测序,2009年1月至2011年1月新甲型H1N1流感病毒的HA基因的氨基酸序列与参考株具有高度的同源性,其亲缘系数为98.9%~100%,且HA基因氨基酸序列发生了一定的变异.[结论]2009年至2011年新甲型H1N1流感病毒的基因组HA序列与我国和其他国家的新甲型H1N1流感病毒具有高度的同源性,但HA基因的氨基酸序列发生了变异,可能与患者的病情有关,因此需密切关注新甲型H1N1流感病毒的流行情况.

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