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江苏省HIV-1基因型抗病毒治疗失败患者耐药检测结果分析
目的 了解江苏省2010-2014年HIV-1感染者抗病毒失败人群的HIV-1耐药情况,为临床抗病毒治疗提供参考.方法 根据耐药检测实验室网络收集江苏省2010-2014年的HIV-1基因型耐药检测结果,对各年度相关药物耐药情况、耐药基因位点及病毒基因亚型进行统计分析.结果 2010-2014年分别纳入样本74、113、197、278、346份,其中检测出现耐药结果的比率分别为68.92％、48.67％、51.27％、52.52％和57.80％.各年度间HIV-1主要耐药药物类似,核苷类主要有3TC、ABC、DDI和FTC,非核苷类药物以EFV和NVP为主.HIV-1对蛋白酶类药物耐药差别较大,且目前使用的LPV/r的耐药率在1％以下.年度间HIV-1主要耐药位点为184、181、190及103位,其中184位突变主要引起3TC和FTC耐药,而181、190、103位突变与EFV和NVP耐药相关.HIV-1病毒基因亚型均以CRF01 _AE为主,且呈上升趋势.结论 江苏省HIV感染者抗病毒治疗失败人群HIV-1基因型耐药率有上升趋势,应加强对抗病毒治疗患者的耐药检测,从而及时合理调整抗病毒治疗方案.
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两种HIV-1基因型耐药检测方法用于干血斑样本的比较
目的 使用两种HIV-1基因型耐药检测方法分别检测干血斑(Dried Blood spot,DBS)样本并比较耐药结果,以期建立适合的检测方法.方法 选择河南省和安徽省经高效抗逆转录病毒治疗(highly active anti-retroviral therapy,HAART)5年以上HIV感染者共35名,采集全血制作干血斑标本,进行CD4+细胞计数和病毒载量测定,分别使用两种文献报道的方法扩增干血斑标本中的HIV-1 pol区核苷酸片段,进行HIV-1基因型耐药检测,并比较34个主要耐药突变位点差异.结果 低载量＜1×103 copies/mL,方法2具有更高的扩增率(5/5),而方法1能扩增成功3份(3/5).方法2共检出269个主要耐药突变位点,两种方法耐药位点的一致率为95.9％(258/269).与方法1比较,有11个耐药位点存在差异,7个位点由混合碱基引起,另4个差异位点则集中为:E138Q和K101Q.结论 两种方法都能够检测病毒载量大于1×103 copies/mL的样本,但是对于低载量样本方法2较方法1有更好的表现,后续应选择更多的不同亚型标本进行研究.
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一种HIV-1耐药基因型检测方法的一致性分析
目的 评价一种实验室自建(in-house)HIV-1耐药基因型检测方法的可重复性.方法 从2008-2010年已进行HIV-1耐药基因型检测(in-house法)的样品中抽取204份再次进行基因型检测,包括核酸的提取、扩增、测序和序列分析,对两次的耐药结果进行比较.结果 204份样品中,对群体耐药发生的判断上一致性很高,可达98.5%(201/204),在每种抗病毒药物是否发生耐药的判断上[92.2 %(188/204)]具有一致性,对每种抗病毒药物的耐药程度判断一致性为81.9%(167/204),84份样品中共有159个位点在两次检测中出现耐药突变位点上不一致的情况,其中不完全一致的位点有149个,蛋白酶区第71位(13/204,6.4%)和逆转录酶区第103位分别出现多(12/204,5.9 %),完全不一致的位点有10个,出现在蛋白酶区第71位,核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)耐药相关突变位点第67、69、70、215、219位,以及与非核苷类逆转录酶抑制剂(NNR-TI)耐药相关突变位点第90、181、221位.结论 in-house方法双重检测对耐药发生及耐药程度的判断上总体具有良好的一致性.但在方法学尤其是混合碱基的判读上需进一步标化以达到更好的可重复性.由于混合碱基的判读会影响耐药突变位点的确定,加强对检测人员的培训,使他们更加严格地执行混合碱基的判断标准和控制序列的质量是非常重要的.
关键词： 人类免疫缺陷病毒1型 In-house 基因型耐药检测 耐药
