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REP、RAPD和PFGE方法在志贺菌分子分型中的应用评价
目的:探讨REP、RAPD和PFGE方法在志贺菌分子分型中的应用效果。方法以细菌基因组重复序列(REP)、随机扩增多态性分析(RAPD)、脉冲场凝胶电泳(PFGE),分别对60株志贺菌分子进行分型,并对3种方法加以评估。结果 REP、RAPD和PFGE的分子分型结果显示,采用REP方法,有A、B两型;采用RAPD方法,有A、B、C、D、E、F六型;采用PFGE方法,共有3个亚型,其中,51株可分为A、B、C、D、E五型,其余6株宋内志贺菌为1单独型。结论在3种分子分型方法中,REP对高菌株分辨率差,在区域内菌株分型方面,不具优势;RAPD分辨率高、分型精准,但需花费较长时间;PFGE明显优于前二者,分型效果更为细致,三者之间的差异性显著,但PFGE操作更简便,用时更少,价格更低,而且对于细菌性痢疾暴发事件,有较好的病学调查效果。