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rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法建立的研究

李伟伟;顾玲;叶珣;陈晓东;丁震;周璐;董晨;张琪;于洋;汪华

摘要: [目的]建立重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)微生物源追踪方法,应用于淮河流域某水库的粪便污染来源追踪.[方法]采集已知来源的人和动物粪便标本以及水样标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增;用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算各源种类的正确归类率.[结果]2分类、4分类和10分类的正确归类率分别为:85.60%、79.20%和70.98%.判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开.水样中主要粪便污染来源为猪、鸡和人.[结论]建立的rep-PCR微生物源追踪方法能较好地区分水体中指示菌的不同来源,该方法的建立为查找水体中粪便污染来源以及水体治理提供了新技术.

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