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rpoD和gyrA基因对气单胞菌鉴定的比较分析

李欣悦;李凤娟;杜鹏程;王瑞白;王多春

摘要: 目的 使用rpoD和gyrA基因对气单胞菌进行种水平的鉴定,比较两者分类结果的差异,同时对本研究中187株气单胞菌进行较为准确的种水平的分类.方法 对生化鉴定的187株气单胞菌进行rpoD和gyrA基因聚合酶链反应扩增并测序,将序列与种特异的参考序列一起构建系统发育树.结果 187株菌经rpoD基因鉴定为7个种,经gyrA基因鉴定为9个种,还有一个未定种.两者鉴定多的3个种一致,即维氏气单胞菌温和生物变种、豚鼠气单胞菌和水族馆气单胞菌.gyrA基因鉴定增加的2个种是异嗜糖气单胞菌和简氏气单胞菌.rpoD和gyrA基因对气单胞菌鉴定一致的有174株(93%),但有13株菌(7%)两者鉴定不一致.结论 rpoD和gyrA基因能够对大部分气单胞菌进行准确一致的分类,对于两者鉴定不一致的菌株,应增加管家基因进行分析.

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