着丝粒蛋白F mRNA在肺腺癌细胞系、肺腺癌组织中的表达变化及相关调控信号通路分析
摘要: 目的 观察着丝粒蛋白F(CENPF)mRNA在肺腺癌细胞系中的表达变化,分析CENPF mRNA在肺腺癌组织中的表达变化并探讨其相关调控信号通路.方法 ①采用实时定量PCR法检测肺正常上皮细胞系BEAS-2B、肺腺癌细胞系(A549、NCI-H1650、NCI-H23、NCI-H1975)CENPF mRNA.②采用癌症基因组图谱(TCGA)的肺腺癌数据集分析CENPF mRNA表达与肺腺癌临床病理参数、预后的关系,Cox回归模型分析肺腺癌患者预后的影响因素.③采用基因集富集分析(GSEA)法分析受CENPF调控的肺腺癌相关信号通路.结果 ①A549、NCI-H1650、NCI-H23、NCI-H1975、BEAS-2B细胞CENPF mRNA相对表达量分别为4.333±0.271、3.193±0.188、2.770±0.091、5.491±0.249、1.006±0.071,A549、NCI-H1650、NCI-H23、NCI-H1975细胞CENPF mRNA相对表达量均高于BEAS-2B(P均<0.05).②肺腺癌、癌旁正常组织CENPF mRNA的相对表达量分别为9.632±0.059、6.472±0.093,二者比较,P<0.001.CENPF mRNA表达与肺腺癌患者的性别、年龄、T分期、N分期及TNM分期相关(P均<0.05).生存分析结果显示,与CENPF mRNA低表达患者比较,CENPF mRNA高表达的肺腺癌患者的预后差(P=0.001).CENPF mRNA表达、临床TNM分期(HR分别为1.667,1.414;P均<0.01)是影响肺腺癌患者预后的因素.③与CENPF mRNA高表达有关的肺腺癌调控信号通路有G2M检查点(P<0.001,FDR<0.001)、有丝分裂纺锤体(P<0.001,FDR<0.001)、E2F靶基因(P<0.001,FDR<0.001)、MYC靶基因(P<0.001,FDR=0.001)、mTOR信号通路(P=0.002,FDR=0.005)、精子形成(P=0.002,FDR=0.009)、未折叠蛋白反应(P=0.002,FDR=0.020)及PI3K/Akt/mTOR信号通路(P=0.015,FDR=0.117)等.结论 肺腺癌组织及细胞系中存在CENPF高表达,CEN-PF高表达与肺腺癌患者的恶性病理特征及不良预后密切相关.CENPF mRNA高表达是影响肺腺癌患者预后的独立危险因素.CENPF可能通过调节G2 M检查点、有丝分裂纺锤体、E2F靶基因、MYC靶基因、mTOR信号通路、精子形成、未折叠蛋白反应及PI3K/Akt/mTOR信号通路在肺腺癌的发生、发展中起重要作用.
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