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基于文献计量学的大鼠心肌梗死模型尿液代谢组学研究
目的 探讨大鼠心肌梗死模型尿液代谢组生物信息学通路.方法 从中国知网、万方数据库、维普数据库、Embase、PubMed数据库中检索大鼠心肌梗死的实验研究,对纳入研究代谢产物进行汇总.信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用metPA网络软件.结果 通过通路拓扑分析选出了3条代谢通路作为大鼠心肌梗死代谢通路,分别是:柠檬酸循环(TCA循环);丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢;精氨酸和脯氨酸代谢.结论 大鼠心肌梗死代谢组生物信息分析显示心肌梗死发病机制涉及糖类、脂肪、蛋白质等物质代谢及其代谢通路.
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基于代谢组学的胃癌组织和血浆的糖代谢研究
背景:肿瘤细胞糖酵解明显增强,但糖酵解对机体全身代谢的影响尚不明确.目的:研究胃癌患者组织和血浆的糖代谢中间产物变化,以建立胃癌局部代谢与机体全身代谢的联系.方法:收集20份慢性胃炎组织、17份胃癌组织、15份慢性胃炎血浆、15份胃癌血浆和15份胃癌术后血浆样本,应用气相色谱-飞行时间质谱(GC-TOFMS)方法检测糖代谢中间产物的变化.结果:共鉴定出13种糖代谢中间产物.与慢性胃炎组织相比,胃癌组织中麦芽糖、葡萄糖、甲基β-D-吡喃葡萄糖苷、6-磷酸果糖、核糖浓度明显降低而乳糖、乳酸、柠檬酸浓度明显升高(P＜0.05).与慢性胃炎血浆相比,胃癌血浆葡萄糖、乳酸、琥珀酸、延胡索酸和苹果酸浓度明显降低而蔗糖、甲基β-D-吡喃葡萄糖苷浓度明显升高(P＜0.05).与胃癌血浆相比,胃癌术后血浆蔗糖、半乳糖酸内酯、甲基β-D-吡喃葡萄糖苷浓度明显降低而葡萄糖、乳酸、柠檬酸、琥珀酸、延胡索酸、苹果酸明显升高(P＜0.05).结论:胃癌组织存在糖酵解、三羧酸循环代谢异常,并对全身代谢产生了影响.基于GC-TOFMS的代谢组学是研究胃癌代谢轮廓的合适平台.
