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CRF 01_AE亚型文献资料
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大连地区HIV-1 CRF01_ AE亚型株基因特征分析
目的 了解大连地区HIV-1 CRF 01_AE亚型株的基因特征及其可能传播链.方法 对2008-2012年新确认144份全血标本进行血浆分离和HIV RNA提取,巢式PCR扩增Env基因并进行序列测定,并对CRF 01_AE亚型毒株序列进行生物信息学分析.结果 得到的HIV感染者有效基因序列中,CRF 0 1_AE亚型占62.14％(64/103),所有病例均为性接触途径传播.系统进化树分析大连CRF01_AE存在2个簇,分别以男男同性传播和异性传播毒株为主,其中男男同性性接触人群(MSM)簇组内平均基因离散率小于异性性接触者(Hetero)簇;与其他地区的CRF 1_AE亚型株构建的系统进化树显示2簇内均无其他国家序列,MSM簇与辽宁(除大连地区,下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01 _AE亚型株位于同一分支,Hetero簇毒株则与辽宁、北京的MSM流行株及东南沿海地区异性传播CRF 01_AE亚型株遗传距离相近.结论 大连市HIV-1 CRF 01_AE株主要通过性接触传播,男男同性传播毒株占主导优势,毒株传入大连时间晚于异性性接触者簇流行株;MSM存在2个以上传播链,与北方部分地区MSM人群中CRF 0 1_AE亚型株存在多次传播.
关键词： HIV-1 CRF 01_AE亚型 进化分析 流行特征
