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基于双核酸频率分布特征的细菌亲缘关系定量分析
目的采用生物信息学方法定量分析细菌的亲缘关系.方法抽取全基因组核酸序列的双核苷酸频率特征向量,表征数字特征.采用Pearson相关系数分析特征向量之间的距离.结果以119个细菌的全基因组核酸序列为研究对象,两两比对的结果为:越是相近的物种,Pearson相关系数越大,PCC距离越小.结论该方法对细菌亲缘关系的定量描述做了有益的探索.
关键词: Pearson相关性系数 双核酸频率特征向量 基因组特征 -
Coltivirus病毒属研究进展
Coltivirus病毒属(Coltivirus,Colti)为呼肠病毒科病毒,以科罗拉多蜱媒热病毒(Colorado tick fever virus,CTFV)为代表株,该病毒原为环状病毒属成员,由于其对人有致病性,可引起人的发热和脑炎,病毒核心的衣壳表面结构不同于典型的环状病毒,尤其是病毒基因组为12个双链RNA节段而不是环状病毒的10个节段,核酸分子量27×106,远比环状病毒(18×106)大,故单列一属.目前全世界已在美洲、亚洲和欧洲等地分离到数十株Colti病毒(主要病毒株的分离年代和地区见表1).
关键词: Coltivirus病毒属 生物学特征 基因组特征 -
华氏巨球蛋白血症的个体化治疗研究进展
华氏巨球蛋白血症(WM)是一种少见的淋巴瘤,目前的治疗手段仍不能治愈.MYD88和CXCR4基因突变是该病的特征.对WM患者的临床表现、病理及遗传学特征等方面的研究进展,已经催生了一系列极具前景的WM临床治疗方案.现结合第59届美国血液学会(ASH)年会关于WM的个体化治疗相关研究进展的新报道,对WM患者应用烷化剂、蛋白酶体抑制剂、单克隆抗体及酪氨酸激酶抑制剂(BTK)等药物的安全性和有效性进行综述,探讨以基因组特征为主的基础治疗与现有治疗方案整合治疗WM的可行性.