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Pyrosequencing测序文献资料
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Sanger和Pyrosequencing测序法分析健康成人口腔菌群
目的 对比Sanger和Pyrosequencing测序法分析健康人口腔菌群组成.方法 收集6例健康成人唾液、舌背、黏膜、龈上及龈下菌斑并构建16S rRNA基因文库,分别用Sanger和Pyrosequencing测序法分析.结果 Sanger测序所得已知的序列有5,794条(占6,535总序列数88.7％)、75个属,396个序列划分操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs,占总OTUs的61.4％).Pyrosequencing测序所得已知的序列有10,771条(占11,103总序列数97.0％)、66个属,322个OTUs(占总OTUs的68.0％).Sanger和Pyrosequencing测序法所得口腔菌群在门、属的水平分布趋势基本一致,但在种的水平分布差异显著.Sanger和Pyrosequencing测序法构建的口腔菌群文库均匀度值分别为0.016和0.007,说明Pyrosequencing分析口腔菌群物种数量分布比Sanger测序方法的文库均匀性稍差,但优势种更显著.结论 Pyrosequencing测序时所构建基因文库能代表口腔菌群的多样性且经济、省时,可以应用于口腔细菌物种的分析.
关键词： 口腔菌群 Sanger测序 Pyrosequencing测序
