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3’-UTR文献资料
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HLA-DQA13’-UTR序列多态性分析及microRNA的调控
目的 揭示HLA-DQAI基因3’-UTR区多态性的进化机制及其对基因表达的调控功能.方法 利用核苷酸变异率计算、系统发育树构建等群体遗传学分析方法将IMGT/HLA数据库中释放的20条HLA-DQAl全长序列多态性进行系统分析,揭示3’-UTR多态性的进化机制.利用miRanda vl.9软件提供的算法,对HLA-DQA1三种差异较大的3'UTR等位基因序列进行microRNA的靶位点预测,对分值较高的预测利用体外荧光细胞实验进行验证.结果 HLA-DQA1基因的3’-UTR具有极高的核苷酸变异率及跨物种多态性,表明其受到平衡选择的作用.预测出14种分值较高的microRNA-靶标复合 物,且14个microRNA与3种DQA1-3’-UTR等位基因靶标的结合自由能以及分值均有不同程度的差异.通过体外荧光表达实验证明,HLA-DQAl受到hsa-mir-658的负调控作用,且hsa-mir-658对DQAl-3’-UTR 3种等位基因特异性的结合对基因表达产生了影响.结论 HLA-DQAl基因表达水平受到microRNA的负调控,且HLA-DQA1 3’-UTR的多态性可影响与microRNA的结合而引起等位基因特异性表达.
