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HLA-DQA13’-UTR序列多态性分析及microRNA的调控
目的 揭示HLA-DQAI基因3’-UTR区多态性的进化机制及其对基因表达的调控功能.方法 利用核苷酸变异率计算、系统发育树构建等群体遗传学分析方法将IMGT/HLA数据库中释放的20条HLA-DQAl全长序列多态性进行系统分析,揭示3’-UTR多态性的进化机制.利用miRanda vl.9软件提供的算法,对HLA-DQA1三种差异较大的3'UTR等位基因序列进行microRNA的靶位点预测,对分值较高的预测利用体外荧光细胞实验进行验证.结果 HLA-DQA1基因的3’-UTR具有极高的核苷酸变异率及跨物种多态性,表明其受到平衡选择的作用.预测出14种分值较高的microRNA-靶标复合 物,且14个microRNA与3种DQA1-3’-UTR等位基因靶标的结合自由能以及分值均有不同程度的差异.通过体外荧光表达实验证明,HLA-DQAl受到hsa-mir-658的负调控作用,且hsa-mir-658对DQAl-3’-UTR 3种等位基因特异性的结合对基因表达产生了影响.结论 HLA-DQAl基因表达水平受到microRNA的负调控,且HLA-DQA1 3’-UTR的多态性可影响与microRNA的结合而引起等位基因特异性表达.
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自然选择与自然选择标记的检测
在人类的进化过程中,自然选择起到了至关重要的作用,选择作用在人类的基因组中留下了标记使我们能够更好地认识人类历史,更多地了解基因多样性及其与疾病、药物反应的关系.