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Rana dybowskii文献资料
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东北林蛙皮肤中一类新抗菌肽cDNA的克隆及成熟肽的预测
为进一步研究和开发高效广谱天然抗生素的抗菌肽,本文克隆东北林蛙(Rana dybowskii)的抗菌肽基因,并预测其成熟肽的有关性质.根据蛙属抗茵肽信号肽末端序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增皮肤中抗菌肽的cDNA,并进行克隆测序.用生物信息学软件分析cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质.研究发现一种长度为28个氨基酸残基的新抗茵肽dybowsin-1,该肽具有Rana box结构;与已发现的抗茵肽仅有35%的同源性;理论等电点在9.70-10.01之间;均呈阳离子性;从第3或4个氨基酸开始到第16个氨基酸形成α-螺旋结构,极性氨基酸位于螺旋轮的一侧,非极性氨基酸位于螺旋轮的另一侧;具有N-端疏水、C-端亲水的两亲性.一个个体表达5条cDNA序列编码3种不同的dybowsin-1分子,显示出该抗菌肽表达的多样性.序列分析显示,该抗茵肽可能由多基因座位编码.
关键词： 东北林蛙 Rana dybowskii 抗茵肽 cDNA 预测
