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2-吲哚酮类血管内皮细胞生长因子受体抑制剂的三维定量构效关系
目的:建立血管内皮细胞生长因子(VEGF)受体酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系.方法:从报道的2-吲哚酮类VEGF受体酪氨酸激酶抑制剂中选取35个化合物,采用分子全局低能量构象以小二乘匹配法叠合分子建立比较分子力场分析(CoMFA)模型.结果:模型的交叉验证系数Q2=0.625,传统相关系数r2=0.968,F5,29=175.475,标准误S=0.124.结论:利用CoMFA方法建立的化合物三维定量构效关系模型有较好的预测能力,可以指导新的活性更优的抑制剂的合成.
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2-吲哚酮类VEGF受体2抑制剂的分子对接和三维定量构效关系
目的:研究VEGFR2抑制剂与靶酶的作用机制,为设计新型抑制剂建立理论模型.方法:应用AutoDock3.05对接2-吲哚酮类抑制剂到靶酶的活性腔,然后以抑制剂的对接构象为基础,在Sybyl6.9中建立抑制剂的比较分子力场分析法(comparative of molecular field analysis, CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(comparative of molecular similarity index analysis, CoMSIA)三维定量构效关系模型.结果:对接构象与文献报道结果一致,三维定量构效关系统计指标Q2均大于0.5.结论:所得结果具有较好的可靠性,对于设计新型化合物具有指导意义.
关键词: 血管内皮生长因子受体2 2-吲哚酮类 分子对接 量化构效关系