首页 > 文献资料
-
HPV58型E6蛋白B细胞表位预测与分析
目的:预测分析高危型人乳头瘤病毒(HPV)58型E6蛋白的B细胞线性表位及其结构.方法:从瑞士生物信息研究所提供的Swissprot蛋白质数据库中检索到E6蛋白序列,采用计算机辅助生物信息学软件进行分析,用Expasy服务器在线软件分析预测E6蛋白的理化性质、二级结构及三维空间结构,采用DNA-STAR软件包中的protean软件进一步分析亲水性、柔韧性、表面可及性、抗原性与极性等特性,再结合氨基酸抗原指数(AI)计算法算出平均AI,根据AI大小预测HPV58型E6蛋白的B细胞线性表位的可能肽段,并进行同源性匹配分析.结果:HPV58型E6蛋白的B细胞线性表位可能位于以下肽段位置:N端8～15(KPRTLHDL)、27～44(ELKCVECKKTLQRSEVYD)、108～127(RPLCPQEKKRHVDLNKRFHN)、141～147(RPRRRQT)肽段及其周围.同源性分析得出肽段27～44、141～147为可能的B细胞线性表位,为HPV58型E6蛋白B细胞表位的独特序列,肽段8～15与HPV33型E6蛋白同源性匹配为100％,108～127与HPV33型E6、HPV9型E6蛋白同源性匹配为100％.结论:27～44、141～147肽段为可能的HPV58型E6蛋白的B细胞优势表位.
-
预测的SARS冠状病毒刺突蛋白S2亚基B细胞表位肽在大肠杆菌中的表达及其抗原性的鉴定
目的:研究预测的SARS冠状病毒刺突蛋白S2亚基B细胞表位肽在大肠杆菌中的表达及其模拟S2蛋白的抗原性.方法:用DNAStar软件对S2亚基序列进行分析,预测B细胞表位所在肽段.通过4轮PCR反应人工搭建预测表位cDNA序列并克隆到含有伴侣10基因的pET28a(+)载体中,构成重组载体pET28-chap10-S2epi.重组蛋白Chap10-S2epi在E.coli BL21(DE3)中表达并以SDS-PAGE和Western blot进行鉴定.用纯化的chap10-S2epi免疫家兔制备抗血清,并通过ELISA判断Chap10-S2epi的抗原性.结果:成功构建并在大肠杆菌中表达了Chap10-S2pei融合蛋白.Chap10-S2epi免疫的抗血清能识别真核细胞表达的SARS冠状病毒全长S2刺突蛋白.结论:预测的SARS冠状病毒S2刺突蛋白B细胞表位肽能够诱导家兔产生针对S2蛋白的抗体,为研制抗SARS病毒基因工程疫苗奠定了基础.
关键词： SARS冠状病毒刺突蛋白 B细胞表位预测 伴侣10分子 S2亚基
