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黑色素瘤抗原A家族文献资料
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MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析
目的:预测和筛选黑色素瘤抗原A(MAGE-A)家族抗原的共同B细胞表位.方法:以MAGE-A1的全长氨基酸序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods的亲水性方案、Zimmerman极性参数和Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等,结合MAGE-A1的二级结构与其柔性区域及跨膜区域对MAGE-A1的优势B表位区段进行综合分析,进一步运用抗原指数分析预测MAGE-A1的B细胞表位,并将其与MAGE-A家族中其他成员(MAGE-A2至A12)进行比对,以预测MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位.结果:MAGE-A1的全长为309个氨基酸,相对分子质量为46 kDa,为可溶性蛋白.经综合分析,其B细胞优势表位可能存在于氨基酸序列N端的9～14,84 ～ 88,118 ～124,160 ～ 165,208 ～ 214,233 ～ 240区段;经与MAGE-A家族中其他成员的氨基酸序列比对,MAGE-A1的9～14,84 ～ 88,118～ 124及233 ～240区段,即HCKPEE,EEEGP,RAREPVTK,GEPRKLLT肽段可能为MAGE-A家族抗原共同B细胞优势表位.结论:利用生物信息学预测发现MAGE-A1的优势B细胞表位中,9～ 14,84 ～ 88,118 ～ 124及233 ～ 240区段可能为MAGE-A家族抗原的共同B细胞表位,可为表位疫苗的研制等提供理论依据.
