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转录间隔区2文献资料
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16S rDNA和ITS2基因序列分析用于难鉴定病原菌分子诊断
目的 利用16S rDNA和转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)基因序列分析方法对难鉴定病原菌进行分子诊断.方法 对某三甲医院4年来的220株难鉴定细菌和130株难鉴定真菌,聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)分别扩增16S rDNA和ITS2基因并测序PCR扩增布鲁氏菌特异基因,并测序进行区分布鲁氏菌和人苍白杆菌,直接从血液标本中提取细菌DNA进行16S rDNA扩增,并与BDPhoenix100微生物分析仪结果进行对比.结果 220株中8株尚未在国内临床感染标本中报道,2株尚未在国外临床报道;130株真菌中2株尚未在国内临床感染中报道.布鲁氏菌特异基因BCSP31可区分布鲁氏菌和人苍白杆菌.100例血培养标本中发现10例16S rDNA和仪器法鉴定结果不一致,以16S rDNA鉴定结果为准.结论 核糖体基因序列分析可以作为临床难鉴定细菌和真菌的分子生物学诊断方法,某些细菌的特异基因检测可作为辅助鉴定方法.
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基于ITS2序列诊断临床深部真菌感染的初步研究
目的 建立以ITS2为靶序列的PCR方法诊断临床深部真菌感染,并进行初步研究.方法 用通用引物扩增纯菌落和临床标本的ITS2区域,对PCR产物测序,测序结果在GenBank中进行Blastn等分析,以此来鉴定真菌属种.结果 10种常见致病性真菌纯菌落和10例临床标本的DNA测序结果均与表型鉴定符合.结论 以ITS2为靶序列的PCR可成为临床快速诊断深部真菌感染的重要方法之一.
