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  • SARS病毒S蛋白部分片段B-细胞表位的多参数预测

    作者:曾桥;万志刚;肖建华;吴移谋;谭立志;万艳平;张文波;杨秋林;尹卫国;刘双全;胡四海

    目的预测SARS病毒S蛋白(spike glycoprotein)部分片段(aa No.400~600 & aa No.1 100~1 195)的B-细胞表位.方法应用多种参数和方法进行综合分析,包括跨膜分析、保守区分析、同源性比较、Hopp & Woods亲水性参数、抗原性参数、可及性参数、β-转角、万氏法等综合预测方法.结果显示B-细胞识别的表位可能在436~456和1 136~1 146残基或其附近,这两个被预测的表位均含有β-转角和不规则卷曲结构.结论本研究为应用合成肽抗原制备抗SARS病毒S蛋白抗体、诊断非典型肺炎(severe acute respiratory syndrome, SARS)提供了依据.

  • 人DAO氨基酸序列片段B-细胞表位的多参数预测

    作者:陈兴;王更银;丛爱丽;张立;许素菊

    目的预测人二氨氧化酶(DAO)氨基酸序列片段(aa No.524-618)的B-细胞表位.方法应用6种参数和方法进行综合分析,包括Hopp&Woods亲水性参数、抗原性参数、可及性参数、β-转角、万氏及吴氏综合预测方法.结果显示B-细胞识别的表位可能在543-553和569-595残基或其附近,569-595残基4种参数和方法的预测值均高于543-553残基,这两个被预测的表位均含有β-转角和不规则卷曲结构.结论本研究为应用合成肽抗原制备抗人DAO抗体提供了依据.

  • 全长人AD7C-NTP基因编码产物的潜在B-细胞表位分析

    作者:桂俊豪;仇东辉;何江;余伍忠;张宇红

    目的预测全长人AD7C-NTP基因产物的潜在B-细胞表位.方法用PHDsec、HNN和Proteinprediction等服务器预测全长人AD7C-NTP基因产物的二级结构;借助ProScale和BcePred等服务器计算AD7C-NTP基因编码产物的亲水性参数、溶剂可及性参数、柔性参数和抗原性指数,综合分析预测结果,确定B-细胞抗原表位.结果 AD7C-NTP基因编码产物的242-248,22-36,71-88和171-190位肽段的亲水性、溶剂可及性、极性和柔性均较高.结论 AD7C-NTP基因编码产物的242-248,22-36,71-88和171-190位肽段是B-细胞优势抗原表位的潜在位点及合成有效人工抗原肽的备选区.