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7q32-ter最小共同缺失区文献资料
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染色体7q32-ter小共同缺失区鼻咽癌抑瘤基因候选者的筛选
目的:在明确7q32-ter区域等位基因杂合性丢失小共同缺失区位于以D7S509为中心的D7S500-D7S509-D7S495的基础上,筛选和克隆位于该区内鼻咽癌相关的候选抑瘤基因.方法:应用定位-候选克隆策略筛选位于该小共同缺失区的3'末端ESTs(expressed sequence tags,ESTs),RT-PCR和Northern杂交筛选出在鼻咽癌细胞株和活检组织中表达下调的ESTs,采用cDNA克隆测序和生物信息学资源获取候选EST的全长cDNA.Southern杂交和甲基化分析研究候选基因表达下调的机制.结果:筛选D7S500 D7S495区域内的12个代表新基因的3'末端ESTs序列,发现一个EST(AI290024)在鼻咽癌细胞株及50%(6/12)的鼻咽癌活检组织中表达下调,Multiple Tissue Northern(MTNTM)Blot杂交结果显示该EST在心、肝、肾等多种组织中存在大小2.0kb的转录本.通过测定包含该EST的cDNA克隆,获得该新基因(命名为NAG-22基因)2.3kb转录本的全长cDNA(GenBank登录号:AF247820),编码77AA,含有disintegrin的结构域.NAG22在NPC中表达下调的机制不是高甲基化和基因拷贝数的丢失.结论:NAG22是定位于7q32-ter小共同缺失区的一个与鼻咽癌相关的抑瘤基因候选者.
关键词： 鼻咽肿瘤 7q32-ter最小共同缺失区 抑瘤基因
