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计算机辅助分子建模(CAMM)文献资料
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tRNAHis/GUG识别特性的分子力学模拟
本文选用经过实验验证的碱基序列,用简化的方式,构建了被水分子和镁离子修饰的核酸序列的分子模型,应用分子力学模拟方法对序列进行能量优化,对优化后序列的构象参数、成键状况和能量数据等进行了分析.对tRNAHHis/GUG的识别特性作了初步的探索 ,得到了和实验结果相近的结论.此外,还从能力学的角度讨论了溶剂-溶质-溶剂相互作用形成的网状氢键网络对核酸结构稳定性的影响,探讨了非Crick-Watson G U、U U配对的能力学特征并存在于被水分子和镁离子修饰的核酸序列中的G U、U U配对情况.