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高G-C含量文献资料
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应用甜菜碱增加富含三核苷酸重复的高G-C含量DNA片段测序辨识度的佳浓度探讨
目的 通过在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱,建立高辨识度的富含三核苷酸重复的高G-C含量DNA片段的测序体系.方法 以G-C含量为72％无三核苷酸重复的Nogo-B基因cDNA的5'端序列(the 5 ' terminal of Nago-B cDNA,Am-Nogo-B)及G-C含量为74％的富含CAG重复与CCG重复的Huntingtin基因cDNA的5'端序列(the 5'terminal of huntingtin cDNA,Am-HTT)为例,在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱,比较测序结果.结果 Am-Nogo-B与Am-HTT基因测序体系中适宜的甜菜碱浓度相差较大.甜菜碱浓度在0.8～1.2 mol/L之间时,Am-Nogo-B测序结果质量佳.甜菜碱浓度在1.6～2.4 mol/L之间时,Am-HTT基因的测序质量好.结果具有良好的可重复性.结论 不同碱基组成类型的高G-C含量DNA片段,即使G-C含量接近,适宜测序体系中甜菜碱浓度不同.探索出了适宜于增加富含三核苷酸串联重复的高G-C含量DNA片段测序辨识度的体系,可作为类似DNA片段测序的参考方法.
