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海洋青铜小单孢菌FIM 02-523全基因组测序及分析
青铜小单孢菌(Micromonospora chalcea,M.chalcea)FIM 02-523能够合成对乏氧肿瘤细胞、艰难梭菌等具有活性的环脂肽类化合物rakicidins.利用Illumina HiSeq高通量测序平台,本研究首次对M.chalcea FIM 02-523进行全基因组测序,得到总长约6.74Mb的序列信息.分析表明基因组GC含量为72.89％,包含了6167个蛋白编码序列.利用AntiSMASH预测基因组中存在19个生物合成基因簇.结合PKS/NRPS生物合成特征和rakicidins化学结构特点,定位到了rakicidins的生物合成基因簇,并初步推测其生物合成途径.研究为M.chalcea FIM 02-523的功能基因组学研究和代谢调控提供了理论基础.
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缩肽类化合物rakicidins体内外抗艰难梭菌活性研究
目的 研究海洋小单孢菌产生的缩肽类化合物rakicidins的体内外抗厌氧菌活性.方法 微量肉汤稀释法测定rakicidins对厌氧菌的小抑菌浓度(MIC);小鼠艰难梭菌感染相关性腹泻动物模型评价rakicidinBx的治疗效果.结果 rakicidinA、B、B1及rakicidinBx对艰难梭菌等革兰阳性厌氧菌有很强的抑制作用,MIC值0.125～0.25μg/mL.Rakicidin Bx对艰难梭菌感染的小鼠的保护作用虽略不及万古霉素和菲达霉素,但是停药后其与菲达霉素一样均未见复发.结论 Rakicidin Bx值得作为抗艰难梭菌感染的候选药物进行研发.
关键词： Rakicidins 缩肽类 艰难梭菌感染 -
海洋小单孢菌产生的抗肿瘤新化合物rakicidin B1
从海洋小单孢菌FIM02-523的发酵液中分离到一个新的缩肽类化合物rakicidinB1(1)及两个已知化合物rakicidinA(2)和rakicidin B(3).通过一维、二维核磁图谱、红外光谱、紫外光谱和高分辨质谱确定了3个化合物的结构.测定了3个化合物对HCT-8、MGC803、A549、A375、HepG2和CASKI5种人肿瘤细胞株的细胞毒活性,结果显示化合物1、2和3对这些肿瘤细胞株均具有显著的抑制活性(对这5个肿瘤细胞株,化合物1的IC50值分别为0.341,0.121,0.394,0.066和2.516μg/mL;化合物2的IC50值分别为0.731,0.991,0.226,0.040和0.576μg/mL;化合物3的IC50值分别为0.347,0.104,0.216,0.041和2.239μg/mL),化合物1和3的抗肿瘤活性相当.
关键词： 小单孢菌 Rakicidins 缩肽 抗肿瘤 -
海洋小单孢菌产生的缩肽类化合物rakicidins抗肿瘤活性研究
研究海洋小单孢菌产生的缩肽类化合物rakicidins的体内外抗肿瘤活性.RakicidinB1、A和B对人结肠癌(HCT-8)细胞有很强的抑制作用,在乏氧培养条件下的抑制作用更强,分别是各自在常氧条件下的15、26和14倍.在移植了HCT-8肿瘤细胞的斑马鱼模型中,B和B1两化合物能显著抑制肿瘤生长.因此,rakicidinB(包括B1)值得进一步作为抗肿瘤药物加以研发.
关键词： Rakicidins 缩肽类 小单孢菌 海洋
