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秀丽线虫野生株系和缺氧敏感株系的差异蛋白质组学研究
目的 研究秀丽线虫(Caenorhabditis elegans)野生株系N2和缺氧敏感株系(ia04)的差异蛋白质,为进行线虫在缺氧环境下的应答机制研究奠定基础.方法 同步化培养2种株系的线虫,培养至L4期时,常规方法提取总蛋白,采用双向电泳分离和串联质谱分析,搜索Swiss-Prot线虫数据库,鉴定蛋白种类并根据基因本体论(gene ontology,GO)进行分析.结果 质谱成功鉴定了其中的25个差异显著蛋白(ratio> 2.0,P<0.05),其中N2株系检测到的表达量比ia04株系高的主要是热休克蛋白(HSP-70,HSP-60)、GTP结合蛋白(TAG-210)、乙酰辅酶A脱氢酶中链(GN=T);ia04株系检测到的表达量比N2高的是延伸因子(EFT-3)和铁硫蛋白-1 (ISP-1),在ia04株系中,HSP的含量明显低于N2株系,说明这可能是ia04株系对缺氧敏感的原因之一.根据GO注释结果发现,鉴定到的这些差异蛋白与线虫的DNA合成及生长发育的相关性较大.结论 蛋白质组学的方法为线虫缺氧的研究提供了有参考价值的数据,不同株系差异蛋白的发现可促进对缺氧应答机制的了解,且可从蛋白质水平揭示重要表型的基因表达机制.
关键词: 秀丽线虫 缺氧敏感株系(ia04) 蛋白质组学 热休克蛋白