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基于高分辨率熔解分析的基因分型新技术
目的 综述基于高分辨熔解分析(HRM)的基因分型新技术.方法 介绍无标记探针、弹回引物、隐蔽探针、温度开关PCR、等位基因特异延伸PCR和低变性温度下共扩增PCR等技术的基本原理并评价其适用性.结果 这些新技术不仅避免了产物污染,提高了HRM基因分型的准确性和敏感度,而且拓展了HRM的应用范围.结论 基于HRM的基因分型新技术有望成为临床分子诊断的新方法.
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无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性
目的:探讨无标记探针技术检测IL-6基因启动子单核苷酸多态性(SNP)的实用性.方法:采用新型荧光染料EvaGreen和无标记探针技术对IL-6基因启动子SNP进行基因分型.以其-597G>A位点为例设计PCR扩增引物和无标记探针,按PCR扩增效率和产物特异性进行Mg2+浓度、不对称PCR引物比例以及模板浓度等条件的优化.并用此优化体系基因分型100例临床标本,杂合型与突变型以测序验证.结果:结果显示EvaGreen荧光PCR检测体系是适Mg2+浓度为2.5 mmol/L,不对称PCR引物比例为0.1/0.5 μmol/L,模板浓度为10 ng/10 μL的两步法不对称PCR.该体系对100例样本进行IL-6基因-597G>A位点基因分型,发现7例杂合型和1例突变型,经测序与检测结果一致.结论:无标记探针技术检测基因SNP是一种值得推广的简便易行、低成本、常规化的基因分型方法.