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  • 应用Label-free技术研究人牙囊细胞和牙周膜成纤维细胞的差异蛋白质

    作者:弓青霞;宋扬;刘佳;王丽颖;金作林

    目的:应用Label-free蛋白定量技术研究牙囊细胞(hDFCs)和牙周膜成纤维细胞(hPDLFs)差异表达蛋白质,为发现hDFCs向hPDLFs转化过程中的重要蛋白质提供参考。方法:应用Label-free 蛋白定量技术,结合ultramate 3000 nano-UPLC软件,对hDFCs和hPDLFs总蛋白提取液进行蛋白定性定量检测。然后分别对蛋白质的鉴定结果行重复性、关联性、蛋白相对含量和差异表达蛋白等进行分析;对总体蛋白质和差异表达蛋白质行生物信息学GO或 KEGG分析。结果:hDFCs和hPDLFs蛋白相对含量及总体蛋白GO分析结果相似。定量分析显示,当hDFCs分化形成hPDLFs后,有22个差异表达蛋白质,其中下调蛋白15个(P<0.05, FC>2),上调蛋白7个(P<0.05,FC>2)。结论:hDFCs和hPDLFs蛋白质表达谱相似;22个差异表达蛋白质为研究hDFCs向hPDLFs的转化机制提供了方向。

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