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能量最小化文献资料
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环氧合酶-2抑制剂设计中小分子构象与能量变化
目的研究环氧合酶-2(COX-2)和配体复合物结构中药物小分子的能量及构象变化,为选择性COX-2抑制剂的研究奠定基础. 方法从PDB库中提取COX-2与选择性抑制剂(SC-588)作用复合物的X-线晶体结构,在由美国Tripos公司提供的Alchemy2000平台上,剥离与之结合的药物小分子SC-588, 然后同孤立态优势构象进行能量及性质比较. 结果复合物晶体结构中药物分子的低能构象及其孤立态优势构象在能量和性质上均有差异. 结论分子活性构象并不一定是低能构象,其能量往往介于孤立态能量和复合物结合状态时低能量之间,根据活性构象可设计新型药物分子.
关键词： 氧合酶类/拮抗剂和抑制剂 计算机辅助设计药物设计 能量最小化
