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人卵透明带3蛋白文献资料
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人卵透明带3蛋白的二级结构和B细胞抗原表位预测
目的:预测并综合分析人卵透明带3(human zona pellucida 3, hZP3)蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位.方法:以hZP3蛋白的基因序列为材料,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus- Schulz法预测其结构蛋白的二级结构及蛋白骨架区的柔韧性,采用Kyte-Doolittle法对蛋白的亲水性进行分析,Emini法预测蛋白的表面可能性,Jameson-Wolf法预测蛋白的抗原指数.结果:hZP3蛋白含有较多的β折叠和转角结构.该蛋白第27～31、36～46、114～133、140～151、237～240和324～329区段可能是α-螺旋中心;hZP3蛋白分子第52～54、60～67、74～78、100～111、158～169、181～185、190～193、210～218、226～229、311～317、335～349和353～360区段可能是β-折叠中心.hZP3蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中近中部区段和近羧基端的第92～95、132～137、171～178、239～245、252～255、279～286、292～305和319～324区段含有潜在的B细胞优势抗原表位.结论:以蛋白质的二级结构预测作为辅助手段,用抗原指数、亲水性参数和表面可能性参数预测hZP3蛋白的B细胞抗原表位,为实验确定hZP3蛋白的B细胞抗原表位并以此进行免疫避孕研究奠定基础.
