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泛素特异肽酶3作为膀胱癌新型预后标记物的研究
目的:明确泛素特异肽酶3(USP3)在膀胱癌中的表达及探讨其作为膀胱癌预后标志物的可能性.方法:采用Oncomine数据库综合比较USP3在膀胱癌组织和正常膀胱组织中的表达.同时采用免疫组织化学方法和荧光定量PCR法检测USP3在膀胱癌及癌旁组织中的表达,以及利用Western Blot和荧光定量PCR法检测膀胱癌细胞株和正常尿路上皮细胞株中USP3的水平,明确USP3在膀胱癌中表达情况.采用TCGA数据库分析USP3与膀胱癌预后的关系;利用STRING数据库预测USP3作用网络,并对可能相互作用蛋白进行GO富集和KEGG Pathway分析.结果:Onconmine数据库中全部的研究结果都显示USP3在膀胱癌中的表达要明显高于正常对照组(P<0.05).免疫组织化学和荧光定量PCR结果证明USP3在膀胱癌中的蛋白和mRNA水平也是明显高于癌旁组织(P<0.05).在细胞水平上,Western Blot和荧光定量PCR的结果同样显示USP3在两种膀胱癌细胞株中的蛋白水平和mRNA水平要高于正常尿路上皮细胞SV-HUC-1(P<0.05).利用TCGA数据库分析发现USP3表达与生存期呈负相关(P<0.05),但是与膀胱癌复发无直接关系(P>0.05).STRING数据库预测与USP3密切相关的蛋白有10个,GO富集分析发现USP3相互作用蛋白的主要功能包括组蛋白去泛素化 、染色体构建 、组蛋白修饰;KEGG Pathway分析发现USP3相互作用蛋白涉及系统性红斑狼疮 、酗酒 、病毒性致癌 、基底转录因子.结论:USP3在膀胱癌中表达上调,与膀胱癌预后密切相关,可能参与膀胱癌的发生发展,作为膀胱癌新型预后标记物有一定的价值.
