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福尔马林固定组织文献资料
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福尔马林固定组织SNP与STR检测的比较
目的 检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率.方法 本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNaPshot复合分型体系和PowerPlex?21试剂盒分别进行SNP与STR检测.结果 大部分样本降解系数在1~8,发生不同程度的降解.与未降解样本相比,SNP分型完全一致,检出率为100%;其中8例样本STR分型存在33个等位基因丢失,降解系数均大于2.6,且75.8%的等位基因片段长度大于300bp.当样本检测出16个STR基因座时,似然率与54个SNP相当.当样本检出大于17个STR时,似然率大于54个SNP.STR基因座片段长度与等位基因检出率之间呈负相关.除2例样本降解系数较小却发生等位基因丢失外,其余样本降解系数与等位基因检出率之间呈负相关.结论 经福尔马林长期固定的组织DNA易降解,检测SNP明显优于STR,但需要更多的SNP以提高个体识别能力.
