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宫内苯并(a)芘暴露对胎儿基因组甲基化的影响
目的 探讨苯并芘暴露对胎儿基因组甲基化的影响.方法 用高效液相色谱法检测27份新生儿脐血血清中的苯并(a)芘(BaP)浓度,并按照BaP浓度将样本分成不同组,采用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)方法检测相应脐血中全基因组甲基化水平,分析不同质量浓度BaP暴露水平与胎儿基因组甲基化水平的关系.结果 27份脐带血血清BaP平均质量浓度为0.185±0.1405 μg/L.按照血清暴露水平分成不同水平暴露组,随着暴露水平的增加,相应的全基因组甲基化的水平有降低趋势.结论 宫内BaP暴露可能会降低胎儿基因组甲基化的水平.
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GMA致人支气管上皮细胞恶性转化过程中全基因组甲基化水平的研究
目的 分析甲基丙烯酸环氧丙酯(glycidyl methacrylate,GMA)致人支气管上皮细胞(16HBE细胞)恶性转化过程中不同时点全基因组甲基化水平的改变,探讨GMA诱导16HBE细胞全基因组甲基化水平改变的意义.方法 通过细胞毒性试验,确定8μg/ml浓度GMA诱导16HBE细胞,收集GMA转化前期(第10代)、转化中期(第20代)、转化后期(第30代)细胞和同步溶剂对照(DMSO)细胞,以及去甲基化制剂(5-氮杂-2-脱氧胞苷,5-aza-cdr)处理的各时点转化细胞,应用DNA甲基化定量检测试剂盒,检测不同转化时期细胞全基因组甲基化水平.结果 DNA甲基化定量检测结果显示,不同时点GMA转化组较同代龄DMSO组细胞全基因组甲基化水平降低,转化前期GMA组、DMSO组、5-aza-cdr组细胞甲基化水平较转化中期及转化后期相对应各组的全基因组甲基化水平低.结论 GMA诱导16HBE细胞在转化前期已出现全基因组低甲基化现象,故可将其视为细胞恶性转化前期生物标志.
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铝致大鼠认知能力和全基因组甲基化改变的研究
目的 研究铝对大鼠认知能力及全基因组甲基化的影响.方法 健康清洁级SD雄性大鼠72只,按体质量随机分成两部分9组,实验部分:对照组(生理盐水),低、中、高铝剂量组(0.27、0.54和1.08 mg/kg);干预部分:对照组(生理盐水),铝高剂量组(1.08 mg/kg),铝高剂量+叶酸低、中、高剂量组(0.7、1.5和3.4 mg/kg),每组8只.各组大鼠腹腔注射相应剂量麦芽酚铝(0.2 ml/d),同时叶酸各剂量干预组每日灌胃叶酸1 ml/100 g,连续60 d.采用Morris水迷宫测定大鼠学习记忆能力,采用ELISA法测定大鼠全基因组甲基化.结果 Morris水迷宫结果显示,铝暴露可导致大鼠目标象限停留时间明显缩短,穿越原平台位置的次数明显减少,铝低、中、高剂量组与对照组比较差异有统计学意义(P＜0.05);叶酸干预铝高剂量组可导致大鼠目标象限停留时间明显延长和穿越原平台位置的次数明显增多,铝高剂量组与铝高+叶酸中、高剂量组比较差异有统计学意义(P＜0.05).大鼠全基因组甲基化测定结果显示:随铝染毒剂量的增加,0.54、1.08 mg/kg染毒组大鼠全基因组甲基化率显著降低,与对照组比较差异具有统计学意义(P＜0.05);而添加高剂量叶酸组全基因组甲基化率显著增加,与铝高剂量组比较差异具有统计学意义(P＜0.05),与对照组比较差异无统计学意义.结论 铝可导致大鼠学习记忆能力下降,大鼠全基因组甲基化率降低,叶酸可能对其有改善作用.
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肥胖对小鼠精子全基因组DNA甲基化以及基因印迹的影响
目的:研究高脂饲料诱导的肥胖是否影响小鼠精子印迹基因差异甲基化区域和精子全基因组DNA甲基化水平. 方法:利用高脂饲料诱导的肥胖小鼠模型,进行精子DNA的全基因组甲基化和印迹基因差异甲基化区测序. 结果:高脂饲料诱导的肥胖组印迹基因差异甲基化区甲基化水平与普通饲料对照组无显著差异:MEG3-IG(93.73％ vs 97.26％;P=0.252),H19(98.00％ vs 97.83％,P=0.920),IGF2(97.34％ vs 96.25％,P=0.166),IGF2R(1.43％ vs 1.11％,P=0.695),PEG3(0.19％ vs0.38％,P=0.537),MEST(0.23％ vs0.68％,P=0.315),NNAT(0.31％ vs 0.00％,P=0.134)和SNRPN(1.88％ vs 3.13％,P=0.628).精子全基因组范围内总共发现8 942个甲基化有显著差异的区域(P＜0.05).对差异甲基化区域进行基因功能富集,富集基因数目多的3项分别为代谢(n=1 482),RNA合成(n=779)和转录(n=767). 结论:高脂饲料诱导的肥胖小鼠精子印迹基因差异甲基化区甲基化水平没有发生显著改变,参与代谢、RNA合成以及转录过程基因CG序列甲基化显著改变.
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正常口腔黏膜全基因组甲基化
目的:了解正常人口腔黏膜全基因组甲基化状态.方法:应用甲基化DNA免疫沉淀技术检测正常人口腔黏膜全基因组甲基化.结果:正常人口腔黏膜中检测出的甲基化CpG岛占总数的16.4％,其中,位于基因启动子区段的甲基化CpG岛占40.2％,甲基化CpG岛和甲基化基因均主要集中于1、2、16、17、19号染色体,甲基化的基因主要集中在与癌症、MAPK、钙信号相关的通路中.结论:人正常口腔黏膜存在甲基化现象,甲基化CpG岛主要集中在富含基因的染色体上.
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全基因组甲基化研究进展
DNA甲基化是常见的表观遗传学改变,甲基化异常往往导致染色体稳定性下降、抑癌基因沉默、X染色体失活,进而导致肿瘤等疾病发生.全基因组DNA甲基化状态分析表明,DNA甲基化在不同类型的肿瘤、肿瘤的各个发展阶段均有差异,与甲基转移酶过表达有一定关联.研究全基因组DNA甲基化图谱可反应基因型与表型关系,为评估肿瘤风险和预后提供指标,从而为癌症的预防、诊断和治疗提供一个新途径.
