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丹参分支酸变位酶基因的克隆和生物信息学分析
应用BlastX检索丹参毛状根的EST数据库,发现1条与分支酸变位酶(chorismate mutase,CM)高度同源的序列,克隆得到其全长cDNA,命名为SmCM1,Genbank登录号为KC784342.SmCM1全长948 bp,理论pI 6.41,与矮牵牛Petunia×hybriida、拟南芥Arabidopsis thaliana和毛果杨Populus trichocarpa的CM1分别具有70％,72％,64％的相似性.实时荧光定量PCR(real time quantitative PCR,QRT-PCR)分析表明SmCM1在丹参叶中的含量较高,其次是茎,在根中的含量相对较低.酵母诱导子(YE)和离子(Ag+)联合诱导丹参毛状根后,SmCM1与莽草酸途径的关键酶3-脱氧-D-阿拉伯-庚酮糖-7-磷酸合酶(3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase,DAHPS)和分支酸合酶(chorismate synthase,CS)基因表达趋势呈协同变化.YE+ Ag+处理后3个基因皆上调表达,8h达到表达高峰,分别是对照的7.9,5.5,9.8倍,随后下调,36 h时下降至对照水平以下,说明诱导处理之后糖代谢中间产物经莽草酸和分支酸途径合成苯丙氨酸和酪氨酸从而引起酚酸类化合物的过量积累.
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大肠杆菌T蛋白的聚合状态分析
目的解析大肠杆菌T蛋白的四级结构.方法利用分段克隆法克隆表达了T蛋白及其两个独立结构域分支酸变位酶(CM,T/1-94)和预苯酸脱氢酶(PDH,T/93-373),再利用SDS-PAGE测得变性条件下T蛋白、CM和PDH的Mr分别为42×103,11×103和32×103,HPLC测得天然条件下CM和PDH的Mr分别为25×103和63×103,再用化学交联法分析聚合状态.结果显示T蛋白、独立结构域CM和PDH均为二聚体.结论说明大肠杆菌T蛋白二聚体是通过CM与CM、PDH与PDH相连的.
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大肠杆菌T蛋白的高效表达和分离纯化
目的构建高效表达菌株,以大量表达大肠杆菌T蛋白,为后续的新药作用靶点研究提供活性蛋白质材料.方法利用高效表达质粒pET26b+克隆了大肠杆菌TyrA基因,并在其C端融合了一个由6个组氨酸组成的his-tag以利分离纯化.结果 T蛋白的表达量达每1 L培养液200 mg,细胞裂解液经一次his-tag亲和柱色谱,纯度达98%,分支酸变位酶和预苯酸脱氢酶的比活性分别为130和98 U*mg-1.结论本法表达的大肠杆菌T蛋白,表达量高,纯化容易,酶活性正常,为进一步研究T蛋白的结构与功能,并进行新药设计奠定了基础.
