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注射用丹参多酚酸盐联合阿司匹林治疗稳定型心绞痛机制的生物分子网络研究
该研究运用生物分子网络分析方法,预测注射用丹参多酚酸盐与阿司匹林联合用药治疗稳定型心绞痛的作用机制.从Genecards,STITCH,DisGeNET数据库获取注射用丹参多酚酸盐、阿司匹林及稳定型心绞痛(stable angina pectoris,SAP)的相关基因;采用Agilent Literature Search文献搜索软件构建生物分子网络;经AP,MCODE和MCL 3种方法对生物网络进行模块识别;通过DAVID软件进行相关KEGG通路识别.结果表明注射用丹参多酚酸盐和阿司匹林对SAP分子网络的覆盖率分别为45.92％,62.56％,联合用药的覆盖率为71.64％.注射用丹参多酚酸盐、阿司匹林与SAP前10个重要节点中,MAPK14,MAPK8,IL-6,IL-8为2个药物共同重叠的SAP重要节点,AKT1和IFNG为注射用丹参多酚酸盐单独重叠的SAP重要节点,EPHB2和TP53为阿司匹林单独重叠的SAP重要节点.2个药物共同参与的SAP相关信号通路包括JAK-STAT信号通路和MAPK信号通路等;注射用丹参多酚酸盐单独参与的SAP相关信号通路包括VEGF信号通路和1型糖尿病信号通路;阿司匹林单独参与的SAP相关信号通路包括AA代谢、亚油酸代谢信号通路等.该研究表明联合用药一方面在抗炎症反应和抑制动脉粥样硬化发展方面有疗效增强作用;另一方面注射用丹参多酚酸盐在阿司匹林抗血小板聚集的基础上能够保护血管内细胞和调节糖代谢,起到疗效相加作用.
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基于生物分子网络的槲皮素生物效应机制
运用代谢组学及生物效应网络方法研究槲皮素生物效应的机制.采用高效液相色谱-质谱(HPLC-MS)联用技术测定空白组与槲皮素给药组大鼠血清,质谱数据采用MATLAB软件处理,利用偏小二乘辨别法分析空白组、槲皮素给药组之间的代谢差异,并通过变量重要性投影选取潜在的生物标志物,结合质谱信息和数据库检索对潜在的生物标志物进行鉴定,确定了4个化合物的结构、代谢途径,以及相关的酶和作用靶点,分别为维生素A酸及视黄醛酸受体(RARβ)、花生四烯酸和COX-2同工酶、3,5-二碘酪氨酸及甲状腺过氧化物酶(TPO)、尿苷二磷酸葡萄糖和磷酸二酯酶(PDEs).通过生物效应网络并结合相关文献证明槲皮素可使维生素A酸对视黄醛酸受体(RARβ)的诱导能力增强、活化甲状腺过氧化物酶(TPO)、还可作为COX-2同工酶和磷酸二酯酶(PDEs)的抑制剂.该研究在生物分子网络调控的层面阐释了槲皮素的多种生物效应,说明代谢组学及生物效应网络方法能用于槲皮素生物效应机制的研究,为进一步揭示药物作用机制提供了新方法.
关键词： 槲皮素 代谢组学 生物分子网络 高效液相色谱-质谱联用 -
网络药理学:中医药与转化医学研究新途径
方剂与证候是中医药的重要特色和中心内容.目前,理解中药方剂与病证的生物学基础是中医药现代研究的一个重点,亟需新的研究方法和途径.随着系统生物学等交叉学科的兴起,以生物分子网络为切入点的网络药理学和网络医学有望系统地刻画中医药的整体性特征,从一个新的视角阐释中医证候的生物学基础和中药方剂的药效物质基础.本文将简要介绍中医药与转化医学的研究现状、生物分子网络在该研究领域中的作用及其应用前景.
