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山羊关节炎脑炎病毒甘肃株文献资料
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山羊关节炎脑炎病毒甘肃株全基因组克隆和序列分析
根据GenBank中发表的山羊关节炎脑炎病毒CAEV-CO株(caprine arthritis encephalitis virus-CO,CAEV-CO)的全基因组序列(序列号:NC-001463),设计合成了7对引物,对CAEV甘肃株的全基因组进行了PCR扩增,并对扩增产物进行了克隆和测序.结果表明,CAEV-甘肃株基因组全长为9 186nt.与国际标准毒株CAEV-CO株相比,在编码区有12个碱基的缺失,二者的核苷酸同源性为91.0%;在非编码区有27个核苷酸的插入,核苷酸同源性为97.0%.gag、pol、蛋白Q、tat、env基因编码的氨基酸同源性分别为94.6%、94.7%、87.9%、94.7%和91.5%.
关键词: 山羊关节炎脑炎病毒甘肃株 基因克隆 序列分析