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中和抗原位点文献资料
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中国部分甲型肝炎病毒流行株结构蛋白区基因特征分析
目的 分析中国部分甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A Virus,HAV)流行株结构蛋白VP3～VP1编码区核苷酸及氨基酸序列特点,并比较与甲肝减毒活疫苗(Hepatitis A Attenuated Live Vaccine,HepA-L)标本序列差别.方法 收集39份甲肝病例急性期血清样本及2份市售HepA-L标本,经核酸提取、逆转录及巢式聚合酶链反应,测得结构-非结构蛋白VP3～VP1-2A编码区序列,进行基因亲缘关系、氨基酸序列同源性等分析.结果 检测到的部分HAV流行株序列均为IA亚型,其在结构-非结构蛋白VP3 ～ VP1-2A编码区核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.8％～ 100％和99.3％～ 100％,与检测的2份HepA-L标本的核苷酸和氨基酸序列同源性为90.6％ ～ 91.9％和99.1％～99.4％.其中的1条序列在VP3-56位,发生丝氨酸(Serine,Ser)→脯氨酸(Proline,Pro)替代;3条序列在VP1-112位,发生苏氨酸(Threonine,Thr)→异亮氨酸(Isoleucine,Ile)替代,靠近中和抗原位点VP1-114位;所有序列在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化.选择压力分析表明,检测到的部分HAV流行株序列在VP3～ VP1编码区处于负向选择.检测的2份HepA-L标本序列均为IB亚型,在已发表的中和抗原位点处氨基酸无变化.结论 HAV的结构蛋白编码区核苷酸序列存在一定差异,但其氨基酸序列相对保守.检测到的3条HAV流行株序列在中和抗原位点附近发生氨基酸替代,值得进一步研究.
