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  • 不同基因型HCV膜区(E2)基因克隆及亲、疏水性分析

    作者:张庶民;李河民;祁自柏;张华远;庄辉;Anders Widell

    目的研究丙型肝炎病毒(HCV)不同基因型膜区序列变异及其变异规律。方法克隆不同基因型HCV的膜区基因,序列测定,核苷酸和氨基酸序列比较和分析。结果不同基因型膜区基因相似性不同,从同一血清样本获得的不同克隆间,其同源性核苷酸大于99.2%,氨基酸大于99.9%。相同亚型核苷酸和氨基酸同源性大于80%。同型基因核苷酸和氨基酸同源性分别为(63.9~75.0)%和(64.9~72.8)%。异型基因同源性核苷酸为(59.4~67.0)%,氨基酸为(56.5~66.3)%。氨基酸序列变化在某些部位有一定保守性。不同基因HCV高变区(HVR)的亲水性和疏水性变化小于其下游3′端区域。结论 HCV基因变化可能有一定规律性。

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