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全基因测序法分析肺炎克雷伯菌JM45株对喹诺酮类药物耐药基因
目的：分析泛耐药肺炎克雷伯菌JM45株携带的喹诺酮类药物耐药基因，研究其对喹诺酮类药物的耐药机制。方法采用Roche454高通量测序技术对肺炎克雷伯菌JM 45株做全基因组测序（完成图），分析喹诺酮类耐药基因携带状况，再将 gy rA与p arC全长基因与其他6株肺炎克雷伯菌做分子进化分析。结果终得到JM 45株一条完整的基因组（染色体）序列及两条质粒序列；基因组（染色体）序列大小为5273812 bp （GC含量65．8％），质粒1序列大小为317156 bp（GC含量53．0％），质粒2序列大小为12209 bp（GC含量55．3％）；在基因组（染色体）序列中携带了 gyrA基因（全基因组Feature ID ：KPN_1614），parC基因（Feature ID ：KPN_0743）；与肺炎克雷伯菌喹诺酮类药物敏感株相比较，gyrA基因第83位密码子由 TCC→ATC ，翻译成氨基酸序列后丝氨酸（Ser）→异亮氨酸（Ile），parC基因第80位密码子由AGC→ATC ，翻译成氨基酸序列后丝氨酸（Ser）→异亮氨酸（Ile）。结论肺炎克雷伯菌 JM45株喹诺酮类药物耐药是 gyrA 基因和 parC 基因喹诺酮耐药决定区（QRDR）突变所致；gyrA与 parC全长基因的分子进化分析提示JM45株与肺炎克雷伯菌 HS11286关系为接近（序列相同），与肺炎克雷伯菌342关系远。
