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E亚型文献资料
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1996～1998年中国流行的E亚型艾滋病病毒1型毒株的分子流行病学研究
目的通过对1996～1998年采集的艾滋病病毒1型(HIV-1)毒株样本的env基因的序列分析,阐明在中国流行的E亚型HIV-1毒株的特点、来源和传播方式.为中国E亚型HIV-1疫苗的研制和应用提供基础资料.方法从HIV感染者淋巴细胞(PBMC)中提取前病毒DNA,使用嵌套式聚合酶链反应(PCR)方法扩增HIV-1的env基因的C2V5区.PCR产物不经克隆直接测序并使用GCG软件包进行序列分析.结果样品采自1996～1998年中国29个省(自治区,直辖市),总共发现37个E亚型HIV-1感染者.他们中大部分是通过性途径感染(23人,占62.2%);部分在静脉吸毒人群中发现(10人,占27.0%);少数是在职业献血员中发现(4人,占10.8%).经C2-V3区序列分析发现,大部分中国E亚型HIV-1毒株与泰国株很相近,而与非洲株相差很大.而来自广西壮族自治区的毒株与越南吸毒人群中的流行株U48720相一致;系统树分析结果发现,中国的E亚型HIV-1株与泰国(CM240X、H93TH966)、越南(U48720)的代表株聚在一起.结论中国E亚型HIV-1毒株目前仅在东南沿海地区流行,涉及静脉吸毒、输供血和性乱等各种人群,通过env区的序列分析发现其主要来源于泰国,部分来源于与中国接壤的越南.
关键词： 艾滋病病毒 E亚型 嵌套式聚合酶链式反应 序列分析 系统树分析
