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HCV基因分型试剂临床应用评价
目的 运用直接测序法和丙型肝炎病毒(HCV)基因分型试剂盒两种方法,诊断HCV基因型并比对它们的结果,以评价HCV基因分型试剂盒的临床使用效果.方法 选取购买的2套商业HCV基因型血清盘和收集的45份HCV核糖核酸(RNA)阳性临床样本,用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增HCV CORE区、NS5B区,对扩增的序列进行测序以确定基因型别;再通过HCV基因分型试剂盒检测样本以确定基因型,对所得结果进行统计分析.结果 HCV NS5B区、CORE区检测商业HCV基因型血清盘,分别检测出16例(16/19)、15例(15/19);对于HCV基因分型试剂盒检测中国常见的五种型别1b、2a、3a、3b、6a的样本,HCV基因分型试剂盒的准确性为7/7.45份HCV RNA阳性的临床样本中,所检测出的基因型有1a(4份)、1b(6份)、2a(5份)、3a(5份)、3b(14份)、6a(7份)、6n(4份),测序法结果属于五种亚型(1b、2a、3a、3b、6a)的有37份标本,试剂盒检测的结果与测序法一致的有29份,8份标本未检出,一致率为29/37.五种亚型以外的8份标本,测序法与试剂盒检测结果均不一致.结论 通过此次对比结果可以看出,所用HCV基因分型试剂盒能够准确检测出国内常见的基因型,并且该方法操作简便,检测时间短,具有较大的临床应用价值.
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HCV基因分型试剂盒评价血清盘的构建与应用
目的 构建HCV基因分型试剂盒评价血清盘,对国内HCV基因分型试剂盒进行评价与应用,以评估我国HCV基因分型试剂盒的质量.方法 收集全国不同省份、不同人群疑似HCV的样本,首先对样本进行筛查试验和病毒载量检测,选取样本的病毒载量大于1 000 IU/ml,再用测序法确定样本的HCV基因型,对确定基因型的样本进行分析,每个基因亚型选择2支,再加上2支病毒载量为阴性的样本,构建成1套HCV基因型试剂盒评价盘,分装并评价其稳定性,并利用评价盘对HCV基因分型试剂盒进行质量评估.结果 HCV NS5B区、CORE区测序基因型结果与血清盘参考预期结果的准确性均为100％(7/7);828份样本中共检测出7种基因亚型,分别为1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n,未检测到其他罕见型别(4型、5型),综合考虑各方面因素,每个基因亚型选择2支样本再加上2支HCV阴性样本共16支样本,组成HCV基因型试剂盒评价盘;经反复冻融3次后检测基因型,其稳定性无影响;利用构建的HCV基因型评价盘对分型试剂盒进行评价,其基因型检出准确性为9/14,其中试剂盒检测范围之内的5种型别有1个样本未检测(3b),而对于检测范围之外的基因型(1a、6n),将基因型1a均错判为1b(2/2).结论 本实验室构建的HCV基因分型评价盘充分考虑了我国HCV基因型的流行情况及国内HCV基因分型试剂盒的检测范围,能够对国内HCV基因分型试剂盒的质量进行有效评价.
