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不同种群蒲公英的内转录间隔区(ITS)序列及其亲缘关系分析
目的 对20个不同种源蒲公英样品内转录间隔区(ITS)序列进行序列测定与分析,分析其遗传关系.方法 用特异引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后,用PCR产物直接测序法测序.用DNASRTAR软件分析测序结果.结果 各样品的内转录间隔区序列总长为711 bp,ITS1、5.8S、ITS2序列长度分别为225、262、226 bp.5.8S区较为保守,ITSI和ITS2碱基频率差异显著.结论 内转录间隔区序列分析技术可用于蒲公英不同种群的亲缘关系分析.
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基于ITS2序列的药用甘草亲缘关系鉴定研究
目的 利用内转录间隔区序列(ITS2)分析收集的181份国内、外甘草样品,对药用甘草及其近缘种样品的亲缘关系进行研究,区分药用与非药用甘草,并推测未鉴定甘草样本与药用甘草的亲缘关系.方法 提取不同基原和产地的甘草样本基因组DNA,PCR扩增获取其ITS2序列,通过序列比对分析、近距离法和邻接(NJ)树分析,建立基于ITS2序列的药用甘草DNA条形码鉴定方法;并利用该方法检测国内变异植株和国外甘草样本.结果 ITS2序列能将药用甘草与其他2个近缘物种很好地区分开;国内疑似变异植株和国外甘草样本在系统树上均与药用甘草聚为一支.结论 该实验为药用甘草建立了基于ITS2条形码序列的鉴定方法;并利用该法,初步鉴定了国内变异植株和国外甘草样本与我国药用甘草的亲缘关系;为扩大药用甘草资源、保证甘草临床用药的安全性和有效性提供了参考.
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天麻ITS序列的聚合酶链反应扩增
目的:为天麻核糖体DNA中的内转录间隔区(internal transcribed spacer ,ITS)序列分析提供可靠、特异的聚合酶链反应(PCR)条件.方法:选择ITS序列通用引物对天麻ITS序列进行PCR扩增,对一系列PCR条件参数进行摸索,同时对PCR产物进行纯化后直接测序.结果:天麻ITS序列PCR扩增产物约为750 bp,不同来源样本存在有一定的差异.经测序后与Genebank中相关序列比对,天麻ITS序列总长度为598 bp,其中ITS1为235 bp,ITS2为209 bp,5.8S为154 bp,G+C(%)为52%.结论:扩增天麻ITS序列的PCR反应条件可以得到可靠、特异的结果.
