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霍山石斛的分子特异性鉴别
目的 基于ITS序列上变异位点设计特异性引物对霍山石斛及其常见混伪品(铁皮石斛和河南石斛)进行有效鉴别.方法 利用大简约法(MP)和贝叶斯法(BI)构建霍山石斛及常见混伪品的系统发育树,并基于ITS序列上变异位点以霍山石斛为正品设计特异性PCR引物SH-CP9s/SH-CP9a、SH-CP25s/SH-CP25a、SH-CP29s/SH-CP29a,优选扩增条件,用于霍山石斛及其混伪品鉴别.结果 在系统发育树中霍山石斛聚类为一个单系.通过对PCR反应的退火温度、DNA模板用量进行优化,并对不同型号的PCR仪和Taq酶进行考察,分别获得霍山石斛的特异性PCR反应程序.在PCR产物中,正品出现目的条带,而混淆品不出现条带.结论 ITS序列能够作为霍山石斛的DNA鉴别条形码,且设计的特异性引物能够有效地区别霍山石斛与其混伪品.
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采用RAPD技术对人参属的亲缘关系和鉴别的分析
目的:分析人参属3种植物的亲缘关系及其可用于鉴别的特异性DNA片段.方法:采用随机扩增多态性DNA分子标记技术(RAPD)对人参属3种药材的基因组DNA进行多态性分析,筛选特异性片段并进行切胶回收、克隆及测序.结果:从120条随机引物中筛选出12条随机引物用于聚合酶链式反应(PCR)扩增,共扩增出111条扩增片段,其中多态性位点107,多态性百分率为96.40％;从聚类分析图可以看出:人参与西洋参的种间亲缘关系近,聚为一类,而三七相对其他2种较远,单独聚为一类;将筛选出的显性标记的特异性片段进行切胶回收、克隆并测序获得其DNA序列.结论:aRAPD标记技术从分子水平提示了人参属3种植物的亲缘关系,并为后期的特异性鉴别提供基础.根据序列设计用于鉴别人参、西洋参、三七的特异性PCR引物,实现从理论研究向药材鉴别实际运用的转变.
