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rDNAITS文献资料
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基于rDNA ITS序列SNP位点的特异性聚合酶链反应引物鉴别青椒和花椒
目的 设计专用于花椒与青椒鉴别的特异性聚合酶链反应(PCR)引物,建立花椒与青椒的分子鉴别方法.方法 本研究提取花椒与青椒样品的DNA,并利用rDNA ITS(核糖体DNA内部转录间隔区)序列通用型引物分别对样品进行PCR扩增,PCR产物经双向测序、比对,寻找单核苷酸多态性(SNP)特异性位点,并分别针对花椒与青椒的SNP位点设计出花椒与青椒的特异性PCR引物,用于花椒与青椒的特异性PCR引物鉴别.结果 所设计的特异性引物为花椒和青椒的鉴别提供了分子鉴定的依据,可以快速、准确地检测出花椒和青椒.结论 本文所设计的特异性PCR引物能有效地鉴别出花椒与青椒,该方法具有准确、高效、灵敏、简便等特点,具有较好的市场应用前景.
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赤水金钗石斛rDNA ITS序列分析
目的:对赤水金钗石斛ITS序列进行序列测定与分析,探讨赤水金钗石斛在ITS片段上的遗传特征,提高道地药材赤水金钗石斛在分子水平的鉴定标准.方法:用特异引物进行PCR扩增,扩增产物纯化后用双脱氧终止法(Sangerdideoxy)测序. 结果:通过与基因库登录的金钗石斛ITS对照,赤水金钗石斛ITS1与ITS2序列的起止范围分别为1～231 bp和395～636 bp.赤水金钗石斛在8位缺失碱基C,在12位缺失碱基A,在82位为碱基A;据此,以NJ法(邻接法)构建了系统树.测序结果登录基因库,序列号:EF618732.结论:金钗石斛ITS1序列基因多态性比ITS2序列更显著;该实验结果为道地药材赤水金钗石斛的物种鉴定补充了新的遗传数据.
