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霍乱弧菌4种新类型tcpA基因发现及序列分析
目的研究中国霍乱弧菌(VC)毒力协同调节菌毛A亚单位基因(tcpA)的多态性.方法分别进行聚合酶链反应及限制性片段长度多态性分析、型特异引物PCR分型、基因测序及序列分析.结果 200株O1群埃尔托型(EVC)产毒株和100株O139群VC产毒株的tcpA基因均与EVC国际标准株N16961株为同一类型(t2型).50株EVC非产毒株中只有3株携带tcpA基因,1株为t2型,另2株为2种新类型.20株O139群VC非产毒株均不携带tcpA基因.20株非O1非O139群VC中只有2株携带tcpA基因,且为2种新类型.4种新类型tcpA基因与国外发现的4种类型比较,基因序列及推测的氨基酸序列同源性分别为58.3%～77.5%和61.0%～85.5%;5′端约102bp基因序列基本一致,推测的氨基酸序列完全一致;3′端约210bp基因序列变异大,推测的氨基酸序列变异也大.抗原表位分析,C末端差异大.结论建立快速准确区分不同类型tcpA基因的方法,并发现4种新类型.
关键词： 霍乱弧菌 毒力协同调节菌毛A亚单位 聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 序列分析 -
霍乱弧菌JS94484株CTXEVCψ和nct-CTXnewψ基因组变异区序列分析
目的对霍乱弧菌JS94484株CTXEVCψ和nct-CTXnewψ基因组变异区进行序列分析.方法采用聚合酶链反应、基因测序及序列分析.结果JS94484株CTXEVCψ基因组的ig1、rstR、ig2和ctxAB基因与EVC标准株N16961的高度同源.JS94484株nct-CTXnewψ基因组的ig1、rstR和ig2基因,与目前发现的3种类型的同源性均较低,趋异性均较高.CTXEVCψ和nct-CTXnewψ基因组zot基因末端约60 bp的基因序列差别较大,推测的氨基酸序列差别也较大.JS94484株的tcpA基因序列与EVC标准株N16961的完全一致.结论霍乱弧菌nct-CTXnewψ基因组的ig1、rstR和ig2基因为新类型,基因功能有待于进一步研究.
关键词： 霍乱弧菌 噬菌体 毒力协同调节菌毛A亚单位 聚合酶链反应 序列分析
